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J-GLOBAL ID：201802228411136830   整理番号：18A1115914

SSRマーカーを用いたKala Bhat(Glycine max(L.)Merrill)遺伝子型の遺伝的多様性と集団構造解析【JST・京大機械翻訳】

Genetic diversity and population structure analysis of Kala bhat ( Glycine max (L.) Merrill) genotypes using SSR markers

著者 (4件)： Hipparagi Yegappa (Division of Plant Genetic Resources, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Singh Rakesh (Division of Genomic Resources, ICAR-National Bureau of Plant Genetic Resources, New Delhi, India) ,  Choudhury Debjani Roy (Division of Genomic Resources, ICAR-National Bureau of Plant Genetic Resources, New Delhi, India) ,  Gupta Veena (Division of Germplasm Conservation, ICAR-National Bureau of Plant Genetic Resources, New Delhi, India)
資料名： Hereditas (Web)  (Hereditas (Web))
巻： 154  号： 1  ページ： 9  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7386A  ISSN： 1601-5223  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Kala Bhat(黒ダイズ)は,その栄養的および医学的性質のため,インド,Uttarakhand州の重要なマメ科作物である。本研究では,Kala Bhatに存在する遺伝的変動性をSSRマーカーを用いて推定し,その変動性をインド,Uttarakhand州で栽培された他の改良ダイズ品種と比較した。【結果】Uttarakハンドの異なる地域で栽培された75の遺伝子型を収集し,21のSSRマーカーを用いて分子分析を行った。全部で60の対立遺伝子を遺伝子座当たり平均2.85の対立遺伝子で増幅した。遺伝子多様性とPICの平均値は,それぞれ0.43と0.36であった。非発根系統樹はダイズ遺伝子型を3つの主要クラスタに分類し,そこでは黄色種皮(改良品種)遺伝子型は1つのクラスタに分類されたが,赤褐色(改良品種)とKala Bhatは相互混合を示した。個体群構造はダイズ遺伝子型を6つの異なる個体群に分割した。AMOVA分析は,個体群間で12%の分散を示し,個体間で66%の分散が,個体内で22%の分散が観察された。主座標分析(PCoA)により,黄色種皮遺伝子型は1つのクラスターに分類されたが,Kala Bhatは散乱分布を示し,Kala Bhatの少数の遺伝子型は赤色及び黄色遺伝子型のグループ化を示すことを示した。結論:本研究で用いた異なる遺伝的多様性パラメータは,Kala Bhat遺伝子型が黄色種皮および褐色種皮色遺伝子型より多様であることを示した。したがって,Kala Bhat遺伝子型は,そのより良い遺伝的多様性とその薬用特性のため,ダイズ育種計画のための良い供給源であることができる。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  品種 ,  クラスタ ,  発根 ,  系統樹 ,  種皮 ,  インド ,  *遺伝子 ,  *遺伝子型 ,  対立遺伝子 ,  ダイズ ,  個体群
準シソーラス用語： 主座標分析 ,  個体群構造 ,  *マイクロサテライトマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ダイズ ,  遺伝的多様性 ,  SSRマーカー ,  種子の色

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  植物分類学  (EH01030N)

引用文献 (51件)：

• USDA National Nutrient Database for Standard Reference Release 18; 2009; CR1;
• Genome; Soybean genetic resources and crop improvement; RJ Singh, T Hymowitz; 42; 1999; 605-16; 10.1139/g99-039; CR2;
• Food and Agriculture Organization of the United Nation, Rome, Italy; 2012; CR3;
• Proc Natl Acad Sci U S A; Soybean susceptibility to manufactured nanomaterials with evidence for food quality and soil fertility interruption; JH Priestera, Y Gea, RE Mielkea, AM Horsta, SC Moritzb, K Espinosae, J Gelbf, SL Walkerg, RM Nisbetb, Y Ani, JP Schimelb, RG Palmere, JA Hernandez-Viezcasc, L Zhaoc, JL Gardea-Torresdeyc, PA Holdena; 109; 2012; 2451-6; 10.1073/pnas.1205431109; CR4;
• Int J Plant Sci; Genetic divergence in soybean [Glycine max (L.) Merril]; NV Kayande, SP Patil; 4; 2009; 218-22; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： SSRマーカー ,  Glycine ,  Max ,  遺伝子型 ,  遺伝的多様性 ,  集団 ,  構造解析