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J-GLOBAL ID:201802228471727553   整理番号:18A1940065

SNP-STRマーカーの新規セットに基づく2人DNA混合物解釈【JST・京大機械翻訳】

Two-person DNA mixture interpretation based on a novel set of SNP-STR markers
著者 (10件):
資料名:
巻: 37  ページ: 37-45  発行年: 2018年 
JST資料番号: W3148A  ISSN: 1872-4973  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 短報  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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PCRおよびキャピラリー電気泳動(CE)により分析した常染色体短鎖縦列反復(STR)マーカーは,法医学的DNA分析のための金標準を表す。検出装置の改良された感度により,従来使用されている微量のDNAから多数の混合DNAプロファイルを得ることができる。より具体的には,victimとperpetratorのDNAから成る2ソースDNA混合物は,しばしば法医のcaseワークで遭遇し,そこではvictimのDNAが混合物の主成分を代表する。残念ながら,20:1以上の比率(ここではこの種の混合物を極端に不平衡なDNA混合物と名付けた)を有する不均衡な2人のDNA混合物は,微量成分に関する限られた情報を提供する。確率論的ソフトウェアの開発は混合DNAからの結果の解釈を容易にしたが,高い混合比は小さな成分を考慮すると,非有益な尤度比(LR)をもたらす。したがって,従来のCEプラットフォーム上で行うことができる一方で,非常に不平衡なDNA混合物中の微量DNAを検出する能力を強化する技術は,法医のcase研究において非常に有用である可能性がある。著者らの以前の研究は,増幅不応性突然変異システム(ARMS)に基づくPCR技術と併せて,SNP-STRsが非常に不平衡な2人のDNA混合物を解決するために使用できることを報告した。このようなDNA混合物の分析に役立つSNP-STRマーカーの能力をさらに調べるために,11の新規SNP-STRマーカーを開発した。その後,ARMSに基づくPCRを用いて対立遺伝子特異的プライマーを設計し,各プライマーがタンデム反復の隣接領域に位置する1つのSNP対立遺伝子を標的とした。この方法により,選択されたSNP対立遺伝子が主要な寄与因子と共有されないため,主成分のDNAからの干渉なしで,特異的かつ選択的に少量のDNAを増幅することができた。南西中国漢民族における選択された11SNP-STRsの調査は,高レベルの多型を示した。2人のDNA混合物に関する分析は,すべての対立遺伝子特異的プライマーが,主要DNAの量が100倍高いときでも,マイナーDNAを標的とすることができることを示した。従って,SNP-STRマーカーのこの新規セットは,極端に不平衡な2人のDNA混合物の分析のための代替法を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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