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J-GLOBAL ID：201802228538626893   整理番号：18A1839464

RNA-Seqは基底型乳癌幹細胞の差次的発現遺伝子を探索した。【JST・京大機械翻訳】

Screening differentially expressed genes in basal breast cancer stem cells by RNA-Seq

著者 (5件)： Li Ting (江南大学 粮食発酵工芸与技術国家工程実験室,无錫214122;江南大学 生物工程学院,无錫214122) ,  Li Lu (江南大学 粮食発酵工芸与技術国家工程実験室,无錫214122;江南大学 生物工程学院,无錫214122) ,  Wang Shuyue (上海科技大学 生命科学与技術学院,上海,201012) ,  Dai Xiaofeng (江南大学 粮食発酵工芸与技術国家工程実験室,无錫214122;江南大学 生物工程学院,无錫214122) ,  Bai Zhonghu (江南大学 粮食発酵工芸与技術国家工程実験室,无錫214122;江南大学 生物工程学院,无錫214122)
資料名： Shengwu Xue Zazhi  (Shengwu Xue Zazhi)
巻： 35  号： 2  ページ： 1-6  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2987A  ISSN： 2095-1736  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 基底型乳癌の多くの特性は腫瘍幹細胞とよく似ており、基底型乳癌のキーターゲットをスクリーニングするため、乳がん幹細胞から始まる。乳癌幹細胞マーカーCD44+CD24-/lowを用いて、HCC1937とSUM149PT乳癌細胞系の幹細胞と非幹細胞を選別し、ハイスループットトランスクリプトームを用いて、幹細胞と非幹細胞の差次的発現の遺伝子を選別した。関連バイオインフォマティクス解析を実施して,部分的差異発現遺伝子を,qRT-PCRによって検証した。その結果,合計134の遺伝子がスクリーニングされ,39の遺伝子が幹細胞で上方制御され,95の遺伝子が下方制御された。生物学的過程、細胞成分、分子機能の3方面のGO機能の分類から、差異遺伝子の濃縮が最も顕著な項目はそれぞれ細胞外基質の組成、細胞外領域、ペルオキシダーゼ活性であり、KEGGの濃縮は発現遺伝子の最も顕著な濃縮の通路が腫瘍の関連通路であることを発見した。qRT-PCRの結果は,幹細胞における差異発現遺伝子の傾向が,トランスクリプトーム配列の結果と一致することを示した。腫瘍幹細胞の全トランスクリプトームレベルに対する研究を通じて、その肝心な差次的発現遺伝子をスクリーニングし、腫瘍幹細胞の分子メカニズム及び基底型乳癌の標的治療の解明に理論基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 腫瘍 ,  *遺伝子 ,  *幹細胞 ,  細胞構成体 ,  *基底 ,  ダウンレギュレーション ,  *乳房腫瘍 ,  トランスクリプトーム ,  細胞外マトリックス ,  *RNA【核酸】 ,  アップレギュレーション ,  分子標的療法
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  乳癌細胞 ,  *差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： 基底 ,  乳癌幹細胞 ,  差次的発現 ,  遺伝子 ,  探索