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J-GLOBAL ID：201802229087612448   整理番号：18A1523076

蘭花eIF5A遺伝子ファミリー同定とバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics and Identification of eIF5A Gene Family in Phalaenopsis equestris (Schauer) Rchb.f.

著者 (6件)： Zhang Jiewei (北京市農林科学院北京農業生物技術研究中心/農業基因資源与生物技術北京市重点実験室,北京,100097) ,  Tang Jiuyang (北京農業職業学院,北京,102442) ,  Chen Lanfen (北京農業職業学院,北京,102442) ,  Wang Ninglin (浙江商業職業技術学院,浙江杭州,310083) ,  Wang Hongzhi (北京市農林科学院北京農業生物技術研究中心/農業基因資源与生物技術北京市重点実験室,北京,100097) ,  Wei Jianhua (北京市農林科学院北京農業生物技術研究中心/農業基因資源与生物技術北京市重点実験室,北京,100097)
資料名： Fujian Nongye Xuebao  (Fujian Nongye Xuebao)
巻： 32  号： 11  ページ： 1218-1223  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3842A  ISSN： 1008-0384  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 蘭花の真核翻訳開始因子5A(Eukaryotictranslationinitiationfactor5A)を系統的に分析した。eIF5A遺伝子ファミリーは蘭花においてどのように作用し、蘭花のゲノムデータベースを利用し、生物情報学の方法により、蘭花eIF5A遺伝子ファミリーの遺伝子構造を同定した。コードタンパク質とリン酸化部位を予測し、配列比較により進化分析を行った。結果、蘭花eIF5A遺伝子ファミリーはeIF5A1とeIF5A2の2つの遺伝子を含み、それぞれ5個と6個のエクソンを含む。MEの保存モチーフ分析では、ランカeIF5A1とeIF5A2タンパク質は共に1つの保守的なDNA結合オリゴヌクレオチド結合構造域(PF01287)を含有している。リン酸化部位の予測分析により、蘭花eIF5A1とeIF5A2タンパク質は大量の潜在的なリン酸化部位を含むことが明らかになった。以上の結果は、今後の蘭花eIF5A1とeIF5A2タンパク質の機能の解明に重要な手がかりを提供する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 保全 ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  タンパク質合成開始因子 ,  予測 ,  オリゴヌクレオチド
準シソーラス用語： DNA結合 ,  リン酸化部位 ,  遺伝子構造 ,  ゲノムデータベース ,  バイオインフォマティクス ,  遺伝子ファミリー ,  *eIF5A , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Phalaenopsis equestris ,  eIF5A ,  gene family ,  phylogeny analysis

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 花 ,  eIF5A ,  遺伝子ファミリー ,  同定 ,  バイオインフォマティクス解析