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J-GLOBAL ID：201802229686981522   整理番号：18A0218772

ヒツジの口瘡ウイルスの重慶におけるF1L遺伝子クローニングと生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and Bioinformatic Analysis of F1L Gene in Chongqing Orf Virus

著者 (7件)： Li Pengfei (貴州大学動物科学学院,貴陽,550025) ,  Feng Jiang (貴州大学動物科学学院,貴陽,550025) ,  Liu Ai (貴州大学動物科学学院,貴陽,550025) ,  Bao Ximing (貴州大学動物科学学院,貴陽,550025) ,  Zhang Yi (貴州大学動物科学学院,貴陽,550025) ,  Li Ting (貴州大学動物科学学院,貴陽,550025) ,  Xian Simei (貴州大学動物科学学院,貴陽 550025;貴州省動物疫病研究所,貴陽550025)
資料名： Xibei Nongye Xuebao  (Xibei Nongye Xuebao)
巻： 26  号： 9  ページ： 1281-1288  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2199A  ISSN： 1004-1389  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:OrfV-CQ株のF1L遺伝子の分子特徴を分析し、そのコードタンパク質の生物学的機能を予測する。OrfV-CQ株のF1L遺伝子をPCR増幅、クローニング及び配列測定を行い、生物情報学関連ソフトウェアを用いて配列分析を行い、そのコードタンパク質の二次構造、B細胞エピトープ、T細胞エピトープ、保存ドメイン、膜貫通ドメイン及びシグナルペプチドに対して予測を行った。結果により、OrfV-CQ株F1L遺伝子の長さは1023bpであり、340個のアミノ酸をコードすることが分かった。Shanxi株F1L遺伝子のヌクレオチドとアミノ酸の相同性はそれぞれ98.4%と95.0%OO-fV-CQ株F1F1遺伝子コード蛋白質のα-ヘリックス、β-シート、β-ターン、ランダムコイルはそれぞれ11.21%、10.3%、2.73%、75.76%であった。5つのB細胞エピトープ抗原エピトープ,3つのCTLエピトープ,4つのTh細胞エピトープ,膜貫通ドメインとシグナルペプチドはない。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シグナルペプチド ,  PCR法 ,  アミノ酸 ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  エピトープ ,  二次構造 ,  生物活性 ,  *遺伝子クローニング ,  相同性
準シソーラス用語： 膜貫通領域 ,  ドメイン構造 ,  B細胞エピトープ ,  *クローニング ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Orf virus(OrfV) ,  F1L gene ,  Clone ,  Bioinformatics analysis

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (8件)： ヒツジ ,  口 ,  瘡 ,  ウイルス ,  重慶 ,  遺伝子クローニング ,  生物情報学 ,  解析