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J-GLOBAL ID：201802229704718101   整理番号：18A0814208

機械学習は発癌性脱分化に関連する幹細胞特性を同定する【JST・京大機械翻訳】

Machine Learning Identifies Stemness Features Associated with Oncogenic Dedifferentiation

著者 (29件)： Malta Tathiane M. (Henry Ford Health System, Detroit, MI 48202, USA) ,  Malta Tathiane M. (University of Sao Paulo, Ribeirao Preto-SP 14049, Brazil) ,  Sokolov Artem (Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Gentles Andrew J. (Stanford University, Palo Alto, CA 94305, USA) ,  Burzykowski Tomasz (Hasselt University, 3590 Diepenbeek, Belgium) ,  Poisson Laila (Henry Ford Health System, Detroit, MI 48202, USA) ,  Weinstein John N. (The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA) ,  Kaminska Bozena (Nencki Institute of Experimental Biology of PAS, 02093 Warsaw, Poland) ,  Huelsken Joerg (Swiss Federal Institute of Technology Lausanne (EPFL), CH-1015 Lausanne; Switzerland) ,  Omberg Larsson (Sage Bionetworks, Seattle, WA 98109 USA) ,  Gevaert Olivier (Stanford University, Palo Alto, CA 94305, USA) ,  Colaprico Antonio (Universite Libre de Bruxelles, 1050 Bruxelles, Belgium) ,  Colaprico Antonio (Interuniversity Institute of Bioinformatics in Brussels (IB)2, 1050 Bruxelles; Belgium) ,  Czerwinska Patrycja (Poznan University of Medical Sciences, 61701 Poznan, Poland) ,  Mazurek Sylwia (Poznan University of Medical Sciences, 61701 Poznan, Poland) ,  Mazurek Sylwia (Postgraduate School of Molecular Medicine, Medical University of Warsaw, 02109 Warsaw, Poland) ,  Mishra Lopa (George Washington University, Washington, D.C. 20052, USA) ,  Heyn Holger (Centre for Genomic Regulation (CNAG-CRG), 08003 Barcelona, Spain) ,  Krasnitz Alex (Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY 11724, USA) ,  Godwin Andrew K. (University of Kansas Medical Center, Kansas City, KS 66160, USA) ,  Lazar Alexander J. (The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA) ,  Stuart Joshua M. (University of California, Santa Cruz, Santa Cruz, CA 95064, USA) ,  Hoadley Katherine A. (University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Laird Peter W. (Van Andel Research Institute, Grand Rapids, MI 49503, USA) ,  Noushmehr Houtan (Henry Ford Health System, Detroit, MI 48202, USA) ,  Noushmehr Houtan (University of Sao Paulo, Ribeirao Preto-SP 14049, Brazil) ,  Wiznerowicz Maciej (Poznan University of Medical Sciences, 61701 Poznan, Poland) ,  Wiznerowicz Maciej (Greater Poland Cancer Center, 61866 Poznan, Poland) ,  Wiznerowicz Maciej (International Institute for Molecular Oncology, 60203 Poznan, Poland)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 173  号： 2  ページ： 338-354.e15  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 癌の進行は分化した表現型の段階的な消失と前駆体および幹細胞様の特徴の獲得を含む。ここでは,発癌性脱分化の程度を評価するための新しい幹細胞指数を提供する。著者らは,非形質転換多能性幹細胞およびそれらの分化後代から得られたトランスクリプトームおよびエピジェネティックな特徴集合を抽出するために,革新的な1クラスロジスティック回帰(OCLR)機械学習アルゴリズムを用いた。OCLRを用いて,脱分化発癌状態に関連する以前に発見されていない生物学的機構を同定することができた。腫瘍微小環境の分析は,免疫チェックポイント発現および浸潤免疫細胞と癌幹細胞の予期しない相関を明らかにした。著者らは,脱分化発癌性表現型が転移性腫瘍において一般的に最も顕著であることを見出した。単一細胞データへの著者らの幹細胞指数の適用は,腫瘍内分子不均一性のパターンを明らかにした。最後に,指標は腫瘍分化を目的とした新規標的の同定と可能な標的治療を可能にした。ディスプレイを表示した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： エピジェネティクス ,  *発癌性 ,  多能性幹細胞 ,  *脱分化 ,  腫瘍 ,  トランスクリプトーム ,  *機械学習 ,  *発癌 ,  表現型 ,  *幹細胞 ,  不均一性 ,  前駆体 ,  *分化
準シソーラス用語： 免疫細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 癌ゲノムアトラス ,  幹性 ,  癌幹細胞 ,  ゲノム ,  エピゲノム ,  機械学習 ,  汎癌 ,  脱分化

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

タイトルに関連する用語 (5件)： 機械学習 ,  発癌性 ,  脱分化 ,  幹細胞 ,  同定