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J-GLOBAL ID：201802229849649029   整理番号：18A0965718

連鎖球菌における遺伝子必須性のABCの定義【JST・京大機械翻訳】

Defining the ABC of gene essentiality in streptococci

著者 (12件)： Charbonneau Amelia R. L. (Animal Health Trust, Lanwades Park, Suffolk, UK) ,  Charbonneau Amelia R. L. (Department of Veterinary Medicine, University of Cambridge, Cambridge, UK) ,  Forman Oliver P. (Animal Health Trust, Lanwades Park, Suffolk, UK) ,  Cain Amy K. (The Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, UK) ,  Cain Amy K. (Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, Macquarie University, Sydney, Australia) ,  Newland Graham (Animal Health Trust, Lanwades Park, Suffolk, UK) ,  Robinson Carl (Animal Health Trust, Lanwades Park, Suffolk, UK) ,  Boursnell Mike (Animal Health Trust, Lanwades Park, Suffolk, UK) ,  Parkhill Julian (The Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, UK) ,  Leigh James A. (The School of Veterinary Medicine and Science, University of Nottingham, Nottingham, UK) ,  Maskell Duncan J. (Department of Veterinary Medicine, University of Cambridge, Cambridge, UK) ,  Waller Andrew S. (Animal Health Trust, Lanwades Park, Suffolk, UK)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 426  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】飽和細菌突然変異体ライブラリーを調べるための次世代配列決定は,ゲノム全体の遺伝子必須性の割り当てのための前例のない情報を提供する。飽和突然変異体ライブラリーの特異的条件への曝露とその後の配列決定は,条件に関連する遺伝子の必須性を明らかにするために利用できる。ここでは,ウマにおけるstrangleの原因物質であるStreptococcus equi subsp.equiに対する必須遺伝子リストを定義するために,バーコード化トランスポゾン指向挿入部位配列決定(TraDIS)システムを提示する。このグループC連鎖球菌に対する遺伝子必須データをグループAおよびB連鎖球菌のそれと比較した。【結果】pGh9:ISS1の6つのバーコード化変異体を設計し,33000-66000のユニークな突然変異体を含む突然変異体ライブラリを作り出すために使用した。各ライブラリーから抽出されたDNAについてTraDISを行い,データを別々に分析し,組み合わせマスタープールとして分析した。遺伝子必須性は,S.equiゲノムの19.5%が必須であることを決定した。遺伝子必須性をA群とB群連鎖球菌のそれらと比較し,それぞれ9%と89.4%の一致を同定し,3つの種の間で83.7%の全体的一致を確認した。【結論】突然変異体ライブラリーを作り出すためのバーコードpGh9:ISS1の使用は,S.equiおよび他の連鎖球菌における遺伝子機能の割り当てのための非常に有用なツールを提供する。グループA,BおよびC連鎖球菌の共有必須遺伝子セットは,これらの重要な病原性細菌間の密接な遺伝的関係のさらなる証拠を提供する。したがって,ここで報告された遺伝子必須性のABCは,連鎖球菌の機能的ゲノムを報告するための固体基礎を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  バーコード ,  ゲノム ,  *遺伝子 ,  *連鎖球菌属 ,  トランスポゾン ,  DNA【核酸】 ,  細菌
準シソーラス用語： 起因菌 ,  遺伝子機能 ,  B群溶血性連鎖球菌 ,  Streptococcus equi , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： トランスポゾン ,  シークエンシング ,  必須性 ,  バーコード

分類 (3件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

引用文献 (40件)：

• Syst Appl Microbiol; Taxonomic studies on Streptococci of serological Groups C, G and L and possibly related taxa; JAE Farrow, MD Collins; 4; 1984; 483-493; 10.1016/S0723-2020(84)80005-3; CR1;
• PLoS Pathog; Genomic evidence for the evolution of Streptococcus equi: host restriction, increased virulence, and genetic exchange with human pathogens; MT Holden, Z Heather, R Paillot, KF Steward, K Webb, F Ainslie, T Jourdan, NC Bason, NE Holroyd, K Mungall, MA Quail, M Sanders, M Simmonds, D Willey, K Brooks, DM Aanensen, BG Spratt, KA Jolley, MC Maiden, M Kehoe, N Chanter, SD Bentley, C Robinson, DJ Maskell, J Parkhill, AS Waller; 53; 2009; 10.1371/journal.ppat.1000346; CR2;
• PLoS ONE; Gene repertoire evolution of Streptococcus pyogenes inferred from phylogenomic analysis with Streptococcus canis and Streptococcus dysgalactiae; T Lefébure, VP Richards, P Lang, P Pavinski-Bitar, MJ Stanhope; 75; 2012; e37607; 10.1371/journal.pone.0037607; CR3;
• Annu Rev Pathol; Molecular pathogenesis of necrotizing fasciitis; RJ Olsen, JM Musser; 5; 2010; 1-31; 10.1146/annurev-pathol-121808-102135; CR4;
• Adv Exp Med Biol; Pathogenesis of group A streptococcal infections and their sequelae; MW Cunningham; 609; 2008; 29-42; 10.1007/978-0-387-73960-1_3; CR5;

タイトルに関連する用語 (4件)： 連鎖球菌 ,  遺伝子 ,  ABC ,  定義