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J-GLOBAL ID：201802229891893640   整理番号：18A0786627

西大西洋におけるLophelia関連細菌群集の生物地理学的比較は保存コアミクロビオームを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Biogeographic Comparison of Lophelia-Associated Bacterial Communities in the Western Atlantic Reveals Conserved Core Microbiome

著者 (3件)： Kellogg Christina A. (St. Petersburg Coastal and Marine Science Center, United States Geological Survey, St. Petersburg) ,  Goldsmith Dawn B. (St. Petersburg Coastal and Marine Science Center, United States Geological Survey, St. Petersburg) ,  Gray Michael A. (St. Petersburg Coastal and Marine Science Center, United States Geological Survey, St. Petersburg)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 796  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 過去10年にわたって,深海サンゴに関する出版物が3倍になった。深い海洋において重要な三次元生息場所を形成する世界的に分布している強膜のサンゴであるLophelia pertusaに多くの注意が払われている。L.pertusaに関連する細菌群集は,地中海,ノルウェー,イギリス,メキシコ湾(GOM)におけるサイトでの多くの研究によって以前に記述されている。しかし,異なる方法の使用はほとんどの場合に直接比較を妨げる。著者らの目的は,地域内変動を扱い,保存された細菌コアコミュニティを同定することであった。著者らは,西部大西洋内の4つの場所のそれぞれにおいて,L.pertusaの3つの異なるコロニーからサンプルを収集した:GOM内の3つのサイトと米国の東海岸沖の1つ。16S rRNA遺伝子のアンプリコンライブラリーを,V4-V5超可変領域と454ピロシーケンスを標的とするプライマーを用いて作成した。優勢門はProteobacteria(75~96%)であった。ファミリーレベルでは,各サンプルの80~95%が5つのグループから構成されていた。すなわち,Pirelaceae科,Pseudonocaraceae科,Rhodobacteraceae科,Sphingomonadaceae属,および未分類Oceanospirales属である。加重Unifrac距離に基づく主座標解析は,GOMと大西洋サンプル間の明確な区別を示した。興味深いことに,各位置からの複製試料は必ずしもクラスタ化せず,強い部位特異的影響はないことを示した。試料の100%で保存されたコア細菌群集は,芳香族炭化水素の既知の分解者であるNovoスフィンゴobium属とPseudonocardia属の操作的分類単位によって支配された。もう一つのコアメンバー,Propionibacteriumの配列は,ノルウェーとイギリスからのL.pertusaの以前の研究においても見出され,保存された共生生物としての役割を示唆している。試料当たり40,000以上の配列を調べることにより,GOM試料は同定された保存コア配列により支配され,一方,開放大西洋試料は局所的に一貫した細菌のより高い割合を有することを見出した。さらに,予測的機能プロファイリングは,L.pertusa微生物が,化学的自己栄養,栄養素循環,および抗生物質生産に寄与する可能性を強調する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 深海 ,  生息場所 ,  コロニー ,  英国 ,  アメリカ合衆国 ,  独立栄養 ,  メキシコ湾 ,  ノルウェー王国 ,  芳香族炭化水素 ,  地中海 ,  *細菌 ,  クラスタ化 ,  *大西洋
準シソーラス用語： 16S rRNA遺伝子 ,  *細菌群集 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 深海サンゴ ,  ミクロビオーム ,  スクレラクチン ,  アンプリコン配列決定 ,  微生物多様性 ,  メキシコ湾

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  海洋汚濁  (SB02040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 西大西洋 ,  細菌群集 ,  生物地理学 ,  保存 ,  コア ,  ミクロビオーム