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J-GLOBAL ID：201802229912077802   整理番号：18A1594705

臨床検体内のLegionella pneumophilaの低ゲノム多様性【JST・京大機械翻訳】

Low genomic diversity of Legionella pneumophila within clinical specimens

著者 (4件)： David S. (Centre for Genomic Pathogen Surveillance, Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA, United Kingdom) ,  Mentasti M. (Respiratory and Vaccine Preventable Bacteria Reference Unit, Public Health England, Colindale, NW9 5EQ, United Kingdom) ,  Parkhill J. (Pathogen Genomics, Wellcome Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA, United Kingdom) ,  Chalker V.J. (Respiratory and Vaccine Preventable Bacteria Reference Unit, Public Health England, Colindale, NW9 5EQ, United Kingdom)
資料名： Clinical Microbiology and Infection  (Clinical Microbiology and Infection)
巻： 24  号： 9  ページ： 1020.e1-1020.e4  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3155A  ISSN： 1198-743X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Legionella pneumophilaは,環境汚染源から得られた肺炎の重篤な形態であるレジオネラ症の主要な原因である。散発性症例と発生の両方の調査は,各患者から分離されたいくつかのコロニーpick(s)に対する単一の分析に主に依存している。しかし,単一患者内の多様性を記述するデータが不足しているので,最適な数のピックは未知である。ここでは,配列に基づくタイピング(SBT)と全ゲノム配列決定(WGS)を用い,個々の患者の多様性を検討した。10の疫学的に無関係な患者から10分離株のL.pneumophilaを得た。SBTとWGSを行い,同一患者の分離株間で一塩基多型(SNP)を同定した。同じ配列型(ST)を10分離株の各セットについて得た。ゲノム解析を用いて,7人の患者から分離株間でゼロSNPが同定され,1つのSNPの最大値が2人の患者の分離株の間で見つかり,2つのSNPの最大値が1人の患者から分離株の間で見つかった。全宿主内多様性が10分離株で捕獲されていると仮定して,統計解析により,1分離株の分析は全ての観察された遺伝子型を捕捉する70%の機会をもたらし,7分離株は90%の機会をもたらすことを示した。10人の患者から得られた複数のコロニーのSBTとWGS分析は,L.pneumophilaにおける宿主内ゲノム多様性を示さなかった。また,患者あたりの1つのコロニーpickの分析は,レジオネラ症の症例の調査を助けるための信頼できるタイピングデータを得るのに十分であることを示唆した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 患者 ,  *ゲノム ,  統計解析 ,  肺炎 ,  遺伝子型 ,  汚染源 ,  *Legionella pneumophila ,  コロニー ,  一塩基多型 ,  *Legionella ,  レジオネラ症 ,  疫学
準シソーラス用語： タイピング ,  分離株 ,  ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ゲノム多様性 ,  Legionella pneumophila ,  レジオネラ症 ,  レジオネラ症 ,  SBT ,  WGS

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (4件)： 臨床検体 ,  Legionella ,  ゲノム ,  多様性