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J-GLOBAL ID：201802230020904479   整理番号：18A0806603

RAD配列決定に由来する高密度遺伝地図およびVigna unguiculataにおける収量関連形質のQTL分析におけるその応用【JST・京大機械翻訳】

A High Density Genetic Map Derived from RAD Sequencing and Its Application in QTL Analysis of Yield-Related Traits in Vigna unguiculata

著者 (9件)： Pan Lei (Hubei Province Engineering Research Centre of Legume Plants, College of Life Sciences, Jianghan University) ,  Wang Nian (Department of Forestry, College of Horticulture and Forest, Huazhong Agriculture University) ,  Wu Zhihua (National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Center of Integrative Biology, College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University) ,  Guo Rui (Hubei Province Engineering Research Centre of Legume Plants, College of Life Sciences, Jianghan University) ,  Yu Xiaolu (Hubei Province Engineering Research Centre of Legume Plants, College of Life Sciences, Jianghan University) ,  Zheng Yu (Institute for Interdisciplinary Research, Jianghan University) ,  Xia Qiuju (BGI-Agro) ,  Gui Songtao (Department of Genetics, State Key Laboratory of Hybrid Rice, College of Life Sciences, Wuhan University) ,  Chen Chanyou (Hubei Province Engineering Research Centre of Legume Plants, College of Life Sciences, Jianghan University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 1544  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ササゲ[Vigna unguiculata(L.)Walp.]は経済的に重要で半乾燥熱帯で広く栽培されている年間マメ科植物である。しかし,ササゲの高密度遺伝地図はまだ欠けている。ここでは,170個体(2ササゲ親および168F_2:3子孫)の個体群を用いて,RAD配列決定(制限部位関連DNA配列決定)技術に基づいてササゲゲノムに分布する34,868SNP(単一ヌクレオチド多型)を同定した。これらのうち,17996の信頼できるSNPを11のコンセンサス連鎖群(LG)に割り当てた。遺伝子地図の長さは,0.066cM/SNPマーカー遺伝子座の平均距離を有する全体で1,194.25cMであった。この地図とF_2:3集団を用いて,CIM(複合間隔マッピング)法と組み合わせて,収量関連形質の11の量的形質遺伝子座(QTL)をササゲにおける7つのLG(LG4,5,6,7,9,10,および11)上で検出した。これらのQTLは全表現型変異の0.05~17.32%を説明した。これらの中で,4QTLは豆莢長,4QTLは千粒重(TGW),2QTLは豆莢当たりの穀粒数,1QTLはカルポポジウム長であった。これらの結果はササゲおよびVigna属における穀粒収量に関連する遺伝子を理解するための基礎を提供するであろう。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 個体群 ,  熱帯 ,  *ササゲ属 ,  遺伝子 ,  量的形質遺伝子座 ,  *ササゲ ,  マメ科 ,  *遺伝子地図 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 千粒重 ,  表現型変異 ,  SNPマーカー ,  連鎖群 ,  DNA配列 ,  *高密度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Vigna unguiculata ,  RADシークエンシング ,  一塩基多型 ,  連鎖マッピング ,  さや収量関連形質 ,  量的形質遺伝子座

分類 (2件)： 豆類  (FC03035U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 遺伝地図 ,  Vigna ,  収量 ,  形質 ,  QTL ,  分析 ,  応用