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J-GLOBAL ID：201802230287724446   整理番号：18A1871834

癌トランスクリプトームからの非組織特異的コア署名による正確な薬物再配置【JST・京大機械翻訳】

Accurate Drug Repositioning through Non-tissue-Specific Core Signatures from Cancer Transcriptomes

著者 (18件)： Xu Chi (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Xu Chi (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Ai Daosheng (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Suo Shengbao (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Chen Xingwei (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Chen Xingwei (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Yan Yizhen (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Yan Yizhen (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Cao Yaqiang (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Cao Yaqiang (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Sun Na (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Chen Weizhong (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  McDermott Joseph (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Zhang Shiqiang (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Zhang Shiqiang (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Zeng Yingying (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...) ,  Zeng Yingying (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) ,  Han Jing-Dong Jackie (Key Laboratory of Computational Biology, Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Molecular Cell Science, Collaborative Innovation Center for Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences-Max Planck Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Instit...)
資料名： Cell Reports  (Cell Reports)
巻： 25  号： 2  ページ： 523-535.e5  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3124A  ISSN： 2211-1247  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 薬物再配置のための実験的大規模スクリーンは,in vitro条件への制限と実際のヒト条件への適用性の欠如により制限される。ここでは,TCGAデータベースから生成された8,476遺伝子の単一遺伝子変異「非組織特異的」コアトランスクリプトーム(CSs)の参照を用いて,ヒトin vivo条件におけるin silicoスクリーニングを開発した。著者らは,参照シグナルに対する3546の薬物処理プロファイルをスキャンするために,コア-シグネチャ薬物-遺伝子(csD2G)ソフトウェアを開発した。csD2Gは,従来の細胞線ベースの遺伝子摂動署名と既存の薬物再配置法を,被覆率と特異性の両方で有意に上回った。著者らは,これを3つの実証応用で強調した。(1)TGF-β経路を阻害するために,精神医学の再配置されたカテゴリー;(2)高血圧カルシウムチャンネル遮断薬はAMPKを活性化し,AKT経路を阻害し,臨床的電子カルテにより検証された。そして,(3)7つの薬物は,Akt-FoxOとAMPK経路を選択的に標的化し,その結果,ワーム寿命を制御することを予測し,検証した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヒト ,  *トランスクリプトーム ,  in vitro実験 ,  ソフトウェア ,  適応性 ,  スクリーン ,  ターゲティング ,  精神医学 ,  摂動 ,  データベース ,  遺伝子 ,  カルテ
準シソーラス用語： 特異性 ,  バーチャルスクリーニング ,  *再配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 薬物再配置 ,  薬物標的 ,  癌ゲノミクス ,  データ統合解析

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 癌 ,  トランスクリプトーム ,  組織 ,  コア ,  署名 ,  薬物 ,  再配置