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J-GLOBAL ID：201802230948767676   整理番号：18A1292822

MA-LMM01ファージ感染中のブルーム形成シアノバクテリアMicrocystis aeruginosaのトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Analysis of a Bloom-Forming Cyanobacterium Microcystis aeruginosa during Ma-LMM01 Phage Infection

著者 (5件)： Morimoto Daichi (Laboratory of Marine Microbiology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University) ,  Kimura Shigeko (Laboratory of Marine Microbiology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University) ,  Kimura Shigeko (School of Environmental Science, University of Shiga Prefecture) ,  Sako Yoshihiko (Laboratory of Marine Microbiology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University) ,  Yoshida Takashi (Laboratory of Marine Microbiology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 2  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Microcystis aeruginosaは富栄養淡水において大量のブルームを形成し,そこではそれは常に溶解性シアノファージに曝露される。他の海洋シアノバクテリアと異なり,M.aeruginosaは著しく豊富で多様な潜在的抗ウイルス防御遺伝子を有する。興味深いことに,M.aeruginosaを感染させる唯一培養された溶解性シアノファージであるT4様シアノファージMa-LMM01は,宿主光合成の維持と他の海洋シアノファージに豊富な宿主代謝の方向付けに関与する宿主由来遺伝子を欠いている。密接に関連するシアノバクテリアとそれらのファージとのゲノム比較に基づいて,Ma-LMM01は他の海洋シアノファージと異なる新規感染プログラムを用いると予測される。ここでは,RNA-seq技術とin silico分析を用いて,ファージ感染に対する宿主転写応答を明らかにするためにMa-LMM01感染時の転写動力学を調べ,高度に豊富な宿主防御系を避けるためにMa-LMM01により使用される感染プログラムを解明した。ファージ由来の読み取りは感染後1時間でわずかに増加したが,感染後3時間での全細胞性リードの16%から感染後6時間までの全リードの33%に有意に増加した。注目すべきことに,ほとんどの宿主遺伝子(0.17%)は感染時の発現における有意な変化を示さなかった。しかしながら,海洋シアノファージを含む他の溶解性dsDNAファージのように,ファージ遺伝子動力学は,3つの発現クラスを明らかにした:初期(宿主-takeover),中間(複製),および後期(ビリオン形態形成)。初期遺伝子はファージゲノム上の10のオープンリーディングフレーム(gp054-gp063)に及ぶ単一~5.8kbウインドウに集中した。初期遺伝子のいずれも,既知の海洋シアノファージを含む他のT4様ファージの初期遺伝子と相同性を示さなかった。細菌RNAポリメラーゼ(σ~70)認識配列は中期および後期遺伝子の上流領域でも見られたが,ファージ特異的モチーフは見られなかった。著者らの知見は,他の既知のT4様ファージと異なり,Ma-LMM01が宿主プロモーター活性の変化なしに3つの連続した遺伝子発現パターンを達成することを示唆する。宿主の転写レベルにおける有意な変化を引き起こさないこのタイプの感染は,宿主の光合成を維持しながら,宿主防御システムを回避するためにMa-LMM01を可能にするのに有利であるかもしれない。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 海洋 ,  *感染 ,  毒性 ,  RNAポリメラーゼ ,  *バクテリオファージ感染 ,  *バクテリオファージ ,  相同性 ,  培養 ,  形態形成 ,  ゲノム ,  光合成 ,  オープンリーディングフレーム ,  シアノファージ ,  *Microcystis aeruginosa ,  *ミクロキスティス属 ,  *微生物 ,  *植物 ,  *隠花植物
準シソーラス用語： *Microcystis , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Microcystis aeruginosa ,  シアノファージ ,  MA-LM01 ,  RNAシークエンシング ,  毒性ブルーム

分類 (2件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： MA ,  ファージ感染 ,  ブルーム ,  シアノバクテリア ,  Microcystis ,  トランスクリプトーム解析