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J-GLOBAL ID：201802231160426060   整理番号：18A0785885

Bacillus amyloliquefaciens,Bacillus velezensis及びBacillus siamensisはB.subtilis種複合体内の”操作グループB.amyloliquefaciens”を形成する【JST・京大機械翻訳】

Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus velezensis, and Bacillus siamensis Form an “Operational Group B. amyloliquefaciens” within the B. subtilis Species Complex

著者 (5件)： Fan Ben (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, College of Forestry, Nanjing Forestry University) ,  Blom Jochen (Bioinformatics and Systems Biology, Justus-Liebig-Universitaet Giessen) ,  Klenk Hans-Peter (School of Biology, Newcastle University) ,  Borriss Rainer (Fachgebiet Phytomedizin, Institut fuer Agrar- und Gartenbauwissenschaften, Humboldt Universitaet zu Berlin) ,  Borriss Rainer (Nord Reet UG)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 22  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物成長促進モデル細菌FZB42-TはBacillus amyloliquefaciens subsp.plantarum(Borriss et al.,2011)のタイプ株として提案されたが,最近,系統ゲノム解析(Dunlap C.et al.,2016)によりBacillus velezensisと同義であると認識されている。しかし,これまでに,多くの文献は,FZB42の植物関連近縁種を「B.amyloliquefaciens」と考えているが,ここでは,B.amyloliquefaciensのタイプ株である自由生活土壌細菌DSM7~Tに関連するFZB42と関連株の分類学的状態を再検討した。完全なrpoBヌクレオチド配列とコアゲノム配列に基づくDSM7~T.Dendrogramと高い類似性を持つNCBIデータバンクから66の細菌ゲノムを同定し,3つの強固に結合した分枝から成るクレードにクラスター化した。(1)B.amyloliquefaciens,(2)Bacillus siamensis,および(3)B.velezensis,Bacillus methylootrophicusおよびB.amyloliquefaciens subsp.plantarumのタイプ株を含む同種のグループ。3つの単系統クレードはヌクレオチド位置当たり0.01置換の共通突然変異率を共有したが,Bacillus subtilis(ヌクレオチド位置当たり0.1置換)には遠く関連した。3つのクラスターの密接な関連性は,コアゲノムのTETRA,dDDH,ANI及びAAI分析により確認されたが,B.amyloliquefaciens DSM7~Tゲノム配列は,「操作グループB」と命名された種レベル以上の分類単位として考慮されるべきであることを提案した。土壌由来B.amyloliquefaciensと植物関連B.siamensisとB.velezensisから成るアミロiquefaciensは,植物関連ライフスタイルの発達によりゲノムレベルの変化を同定することを可能にする。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヌクレオチド配列 ,  データベース ,  クラスタ化 ,  クラスタ ,  ヌクレオチド ,  類似性 ,  土壌細菌 ,  *桿菌属 ,  DNA【核酸】 ,  *Bacillus amyloliquefaciens
準シソーラス用語： クレード ,  ゲノム配列 ,  *Bacillus methylotrophicus ,  ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 系統ゲノミクス ,  枯草菌グループ ,  Bacillus amyloliquefaciens ,  Bacillus分類学 ,  デジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション ,  平均ヌクレオチドアイデンティティ(ANI) ,  平均アミノ酸アイデンティティ(AAI)

分類 (4件)： 微生物酵素の生産  (FK03030L) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  酵素生理  (EG03052C)

タイトルに関連する用語 (3件)： Bacillus ,  複合体 ,  グループ