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J-GLOBAL ID：201802231203996461   整理番号：18A0469316

連続自動モデルEvaluatiOn(CAMEO)CASP12における構造予測の批判的評価を相補する【Powered by NICT】

Continuous Automated Model EvaluatiOn (CAMEO) complementing the critical assessment of structure prediction in CASP12

著者 (18件)： Haas Juergen (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Haas Juergen (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland) ,  Barbato Alessandro (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Barbato Alessandro (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland) ,  Behringer Dario (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Behringer Dario (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland) ,  Studer Gabriel (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Studer Gabriel (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland) ,  Roth Steven (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Roth Steven (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland) ,  Bertoni Martino (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Bertoni Martino (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland) ,  Mostaguir Khaled (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Mostaguir Khaled (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland) ,  Gumienny Rafal (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Gumienny Rafal (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland) ,  Schwede Torsten (Biozentrum, University of Basel, Switzerland) ,  Schwede Torsten (SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Computational Structural Biology, Basel, Switzerland)
資料名： Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics  (Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics)
巻： 86 Suppl S1  ページ： 387-398  発行年： 2018年 
JST資料番号： T0761A  ISSN： 0887-3585  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： すべて二年目,社会実験「構造予測技術の批判的評価」(CASP)は,構造予測法の独立したブラインド評価を行う,異なる方法の性能を比較し,分野における最新の開発を議論するためのフレームワークを提供した。しかし,自動計算モデリング法の開発者は,より大きなデータセットに基づくより頻繁な評価から利益を得た。「連続自動モデルEvaluatiOn(CAMEO)」プラットフォームはこれらの構造の配列の毎週事前放流に基づく完全自動化ブラインド予測評価,PDB蛋白質データバンクの次の放出に発表予定しようとしているを行ってCASP実験を補完するものである。CAMEOは4日間の予測窓中に収集されたモデルに基づく毎週ベンチマーク結果を公表,5週間の時間枠中の100ターゲットを評価する。CAMEOベンチマークデータは,経時的に同じ点で全ての参加法の一貫して生成し,開発者を可能にするそれらの方法の性能をベンチマークと交差検証し,文献におけるベンチマーキング結果に言及した。サーバ開発を促進し,より短い放出サイクルを促進するために,CAMEOは提出統計と低性能警告と併用した週1回電子メールを送信する。CASPの多くの参加者を成功裏に来るべき地域実験のための方法を調製時CAMEO採用した。CAMEOは構造予測法の多様な面ベンチマーキングを可能にするスコアの多様性を提供する。新しいスコアリングスキームを導入することにより,CAMEOは活発な研究の領域での新しい開発を容易にする,例えば,モデル化四次構造,錯体,または配位子結合部位。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 四次構造 ,  モデリング ,  ベンチマーク ,  結合部位 ,  警報 ,  信頼性 ,  *予測 ,  放流 ,  電子メール
準シソーラス用語： スコア ,  ベンチマーキング ,  蛋白質データベース ,  計算モデル化 ,  社会実験 ,  *構造予測 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： ベンチマーキング ,  CAMEO ,  CASP ,  連続評価 ,  配位子結合部位精度 ,  モデル信頼性 ,  モデル品質評価 ,  オリゴマー評価 ,  蛋白質構造モデリング ,  蛋白質構造予測

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： モデル ,  構造予測 ,  評価