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J-GLOBAL ID：201802231817584191   整理番号：18A0236880

エピゲノムワイド関連研究のための重要性しきい値の推定【Powered by NICT】

Estimation of a significance threshold for epigenome-wide association studies

著者 (10件)： Saffari Ayden (Department of Non-Communicable Disease Epidemiology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, United Kingdom) ,  Saffari Ayden (MRC Unit, The Gambia and MRC International Nutrition Group, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, United Kingdom) ,  Saffari Ayden (Department of Psychological Sciences, Birkbeck, University of London, London, United Kingdom) ,  Silver Matt J. (MRC Unit, The Gambia and MRC International Nutrition Group, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, United Kingdom) ,  Zavattari Patrizia (Department of Biomedical Sciences, University of Cagliari, Cagliari, Sardinia, Italy) ,  Moi Loredana (Department of Biomedical Sciences, University of Cagliari, Cagliari, Sardinia, Italy) ,  Columbano Amedeo (Department of Biomedical Sciences, University of Cagliari, Cagliari, Sardinia, Italy) ,  Meaburn Emma L. (Department of Psychological Sciences, Birkbeck, University of London, London, United Kingdom) ,  Dudbridge Frank (Department of Non-Communicable Disease Epidemiology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, United Kingdom) ,  Dudbridge Frank (Department of Health Sciences, University of Leicester, Leicester, United Kingdom)
資料名： Genetic Epidemiology  (Genetic Epidemiology)
巻： 42  号： 1  ページ： 20-33  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2580A  ISSN： 0741-0395  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エピゲノムワイド関連研究(EWAS)はゲノムを超えた個体群レベル後成的相違を特性化し,疾患にそれらを結び付けるように設計されている。最も一般的には,それらはシトシン-グアニンジヌクレオチド(CpG)部位でのDNAメチル化状態,ゲノムワイドのCpGのサブセットプロファイルをIllumina450Kアレイのようなプラットフォームを用いて評価した。EWASとの関連で重要な課題は,異なるメチル化としてのCpG部位を宣言の重要性しきい値を決定し,多重検定を考慮に入れた。置換法を用いて,450Kアレイとゲノムワイドしきい値を推定するためのシミュレーション外挿法のために特別に有意性閾値を推定した。それら方法は,さまざまな集団と組織型から誘導した五種の異なるEWASデータセットに適用した。450Kアレイのためのα=2.4×10 7の推定,およびα=3.6×10 8のゲノムワイドな推定を得た。EWAS以前に推奨されるサンプルサイズは上方調整し,所望のレベルで1型誤差を維持するために間~10%と~20%大きい試料を必要とすべきであることを示すことにより,これらの結果の重要性を実証した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 個体群 ,  外挿法 ,  メチル化 ,  多重化 ,  キャラクタリゼーション ,  シミュレーション ,  置換工法 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： 組織型 ,  DNAメチル化 ,  CpG , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： CpG ,  DNAメチル化 ,  エピジェネティック疫学 ,  EWAS ,  FWER ,  GWAS ,  置換 ,  再標本化 ,  シミュレーション外挿

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (5件)： エピゲノム ,  研究 ,  重要性 ,  しきい値 ,  推定