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J-GLOBAL ID：201802232821337252   整理番号：18A0806108

長鎖非コードRNA NERDLとその標的遺伝子間の相互作用はPopulus tomentosaにおける木材形成に影響する【JST・京大機械翻訳】

The Interactions between the Long Non-coding RNA NERDL and Its Target Gene Affect Wood Formation in Populus tomentosa

著者 (12件)： Shi Wan (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Shi Wan (National Engineering Laboratory for Tree Breeding, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Shi Wan (Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Quan Mingyang (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Quan Mingyang (National Engineering Laboratory for Tree Breeding, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Quan Mingyang (Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Du Qingzhang (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Du Qingzhang (National Engineering Laboratory for Tree Breeding, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Du Qingzhang (Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Zhang Deqiang (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Zhang Deqiang (National Engineering Laboratory for Tree Breeding, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University) ,  Zhang Deqiang (Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of Education, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 1035  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 長い非コードRNA(lncRNA)は植物成長と発生のための重要な調節因子であるが,多年生植物におけるmRNAとlncRNAの対立遺伝子相互作用についてはほとんど知られていない。本研究では,NERD(RDR2非依存性DNAメチル化)Populus tomentosa遺伝子PtoNERDとその推定調節因子,lncRNA NERDL(NERD関連lncRNA)との相互作用を解析し,この遺伝子のプロモーター領域と部分的に重複した。8つの組織における発現分析は,NERDLとPtoNERD(r=0.62)の間に正の相関を示し,NERDLとその推定標的との相互作用が木材形成に関与している可能性があることを示唆した。P.tomentosa(435の無関係な個体)の自然個体群における関連マッピングを行い,遺伝的変異とPtoNERDとのlncRNA NERDLの相互作用を評価した。添加剤と優性モデルを用いて,5つの樹木成長と木材特性形質に関連する30のSNP(P<0.01)を同定した。各SNPは表現型分散の3.90~8.57%を説明し,NERDLとその推定標的が木材形成に共通の役割を果たしていることを示唆した。エピ停滞分析は,NERDLとPtoNERDの間の9つのSNP-SNP会合対を,-7.55から2.16%の情報利得で明らかにし,NERDLとその推定標的の間の強い相互作用を反映した。この分析は,mRNAとlncRNAの遺伝的相互作用を解読するための強力な方法を提供し,樹木における量的形質の複雑な遺伝的ネットワークを分析する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 優性 ,  *ハコヤナギ属 ,  遺伝学 ,  個体群 ,  プロモーター領域 ,  植物成長 ,  *相互作用 ,  *木材 ,  多年生草 ,  mRNA
準シソーラス用語： 遺伝的変異 ,  DNAメチル化 ,  調節因子 ,  *非翻訳RNA ,  *標的遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 関連遺伝学 ,  NERDL ,  lncRNA-mRNA相互作用 ,  エピepist ,  木材の形成

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 長鎖非コードRNA ,  標的遺伝子 ,  相互作用 ,  Populus ,  木材