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J-GLOBAL ID：201802232827541663   整理番号：18A0757724

メタゲノミクスにより明らかにされたジkaryotic真菌(Inocybe terrigena,Inocybaceae)のゲノムとミクロビオーム【JST・京大機械翻訳】

The genome and microbiome of a dikaryotic fungus (Inocybe terrigena, Inocybaceae) revealed by metagenomics

著者 (6件)： Bahram Mohammad (Department of Organismal Biology, Evolutionary Biology Centre Uppsala University, Norbyvaegen 18D, Uppsala, 75236 Sweden) ,  Bahram Mohammad (Department of Botany, Institute of Ecology and Earth Sciences, University of Tartu, 40 Lai St, Tartu, 51005 Estonia) ,  Vanderpool Dan (Division of Biological Sciences, University of Montana, 32 Campus Drive, Missoula, MT 59812, USA) ,  Pent Mari (Department of Botany, Institute of Ecology and Earth Sciences, University of Tartu, 40 Lai St, Tartu, 51005 Estonia) ,  Hiltunen Markus (Department of Organismal Biology, Evolutionary Biology Centre Uppsala University, Norbyvaegen 18D, Uppsala, 75236 Sweden) ,  Ryberg Martin (Department of Organismal Biology, Evolutionary Biology Centre Uppsala University, Norbyvaegen 18D, Uppsala, 75236 Sweden)
資料名： Environmental Microbiology Reports  (Environmental Microbiology Reports)
巻： 10  号： 2  ページ： 155-166  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2562A  ISSN： 1758-2229  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分子法における最近の進歩は種々の菌類共生の理解を増加させた。しかし,ほとんどの非培養共生真菌クレードのゲノムおよび微生物学的特徴についてはほとんど知られていない。ここでは,広い種類の植物種と共生的な関連を形成することが知られている多くの非培養外生菌根クレード,Inocybaceae(Agaricales,Basidiomycota)のゲノムと微生物を分析した。著者らは,Inocybe terrigena(Fr.)Kuyperからの二核分裂体組織のメタゲノム配列決定および集合を用いて,真菌および細菌ゲノム配列を分類し,93%のコア真核生物遺伝子を含むほぼ完全な真菌ゲノムを得た。比較ゲノミクスにより,I.terrigenaは白色腐朽菌よりも外生菌根及び褐色腐朽菌に類似していることを明らかにした。リグニン分解能の低下は密接に関連する外生菌根クレードにおけるよりも独立しており,外生菌根共生がInocybeにおいて独立に進化したことを支持する。I.terrigena果実体の微生物は,他の菌類および非真菌宿主環境において既知の共生機能を持つ細菌を含み,生息場所条件に関係なく真菌組織におけるこれら細菌の潜在的共生機能を示唆する。本研究は,真菌ゲノムと微生物を特性化するための果実体組織の直接メタゲノム解析の有用性を示す。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生息場所 ,  *真菌類 ,  真核生物 ,  キャラクタリゼーション ,  *ゲノム ,  培養 ,  細菌 ,  共生
準シソーラス用語： 白色腐朽菌 ,  比較ゲノミクス ,  真菌ゲノム ,  メタゲノム ,  外生菌根 ,  クレード ,  *メタゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (5件)： 木材化学  (FF05040V) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  微生物の生態  (EG03040J) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  土壌生物  (FB04050N)

タイトルに関連する用語 (4件)： メタゲノミクス ,  真菌 ,  ゲノム ,  ミクロビオーム