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J-GLOBAL ID：201802233022148594   整理番号：18A2024582

血清無細胞DNAのサイズプロファイリングのための単一分子フリー溶液流体力学的分離【JST・京大機械翻訳】

Single Molecule Free Solution Hydrodynamic Separation for Size Profiling of Serum Cell-Free DNA

著者 (3件)： Li Andrew (Biomedical Engineering Department, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, 21212, USA) ,  Friedrich Sarah M. (Biomedical Engineering Department, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, 21212, USA) ,  Wang Tza-Huei (Mechanical Engineering Department and Biomedical Engineering Department, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, 21212, USA)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2018  号： EMBC  ページ： 4476-4479  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 循環無細胞DNA(cfDNA)は非侵襲的バイオマーカーとして重要な関心を集めている。1つの重要なアクセス可能なパラメータ,cfDNAサイズ分布は有意な値であるように見える。ここでは,ヒト血清からのcfDNAサイズプロファイルのロバストな特性化のための単一分子フリー溶液流体力学分離プラットフォーム(SML-FSHS)を紹介する。このプラットフォームは,DNAサイジングのための流体力学的分離と,DNA分子の高感度単一分子検出と定量のための円筒照明共焦点分光法(CICS)を利用する。最初に,塩基対におけるDNAサイズに対するDNA保持時間に関連する検量線を作成するために,インターカレーション染料で染色されたカスタム広ダイナミックレンジDNAラダー(50BP-23kbp)を用いた。このことから,本システムは広いサイジングダイナミックレンジと高分解能~5%のフラグメント長を持つ臨床試料におけるcfDNAサイズ分布を単一操作でプロファイルできることを示した。この方法は,貴重な試料の無視できる(3pL)体積を消費し,PCRや配列決定などの他の方法に影響を及ぼす試料処理バイアスを最小化する。また,ステージ1V癌患者からのcfDNAサイズ分布を正常患者サンプルと比較し,特異的cfDNAサイズ範囲が病態と相関する可能性があることを示した。加えて,cfDNAを絶対的に定量し,サイズによる細胞汚染の寄与を明らかにすることができる。これらの特性により,このプラットフォームは将来の循環DNA研究の加速に役立つと信じる。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  ロバスト性 ,  試料調製 ,  *血清 ,  患者 ,  ダイナミックレンジ ,  検量線 ,  バイオマーカー ,  高分解能 ,  インターカレーション ,  バイアス ,  高感度 ,  *流体力学 ,  *DNA【核酸】
準シソーラス用語： *単一分子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (7件)： 血清 ,  無細胞DNA ,  サイズ ,  プロファイリング ,  単一分子 ,  溶液 ,  流体力学