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J-GLOBAL ID：201802233300577059   整理番号：18A1293984

環境バイオフィルム試料におけるクオラムセンシングメタゲノムのin silico分析【JST・京大機械翻訳】

In Silico Analysis of the Quorum Sensing Metagenome in Environmental Biofilm Samples

著者 (2件)： Barriuso Jorge (Centro de Investigaciones Biologicas, Consejo Superior de Investigaciones Cientificas) ,  Martinez Maria J. (Centro de Investigaciones Biologicas, Consejo Superior de Investigaciones Cientificas)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 1243  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： クオラムセンシング(QS)は,「自己誘導物質」と呼ばれる小拡散分子により仲介される細胞シグナル伝達機構に対する精巧な細胞であり,これらの現象は生物膜形成において良く研究されており,これらの現象は生物膜形成に関与している可能性があり,ここでは,JGIデータベースからの全公開可能生物膜メタゲノムにおけるQS蛋白質のin silicoスクリーニングを示した。候補の配列,保存モチーフ,系統発生および三次元構造解析を行い,メタゲノム配列におけるQS蛋白質を探索するための効果的な戦略を得た。各試料に存在するQS蛋白質の数とその系統発生は細菌の多様性と生物膜の起源に明らかに関連していた。自然生息地から分離された試料は,人工生息地から分離された試料と明確な差異を示し,Bacteroidetes細菌におけるシンターゼと受容体蛋白質の不均衡比を見出すLuxR様蛋白質の豊富さに興味ある知見が得られ,この群における「cheather」の存在を指摘した。さらに,Nitrospira分類群からの細菌におけるLuxI/RQS系の存在を示した。最終的に,HDTsファミリーからのいくつかの非記述蛋白質がガンマ-プロテオバクテリアにおいて見出された。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 系統発生 ,  データベース ,  タンパク質 ,  *生物膜 ,  生息場所 ,  遺伝子 ,  合成酵素 ,  細菌
準シソーラス用語： プロテオバクテリア ,  Nitrospira ,  LuxR蛋白質 ,  バクテロイデス門 ,  *メタゲノム ,  *クオラムセンシング ,  *in silico , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： クオラムセンシング ,  LUX遺伝子 ,  AI-2 ,  メタゲノム ,  バイオフィルム

分類 (4件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (4件)： 環境 ,  バイオフィルム ,  試料 ,  分析