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J-GLOBAL ID：201802233502013454   整理番号：18A0482466

Arabidopsis thalianaL.におけるワイド同定と特性化NO応答性WRKY転写因子のTranscriptome【Powered by NICT】

Transcriptome wide identification and characterization of NO-responsive WRKY transcription factors in Arabidopsis thaliana L.

著者 (8件)： Imran Qari Muhammad (Laboratory of Plant Functional Genomics School of Applied Biosciences, Kyungpook National University, Daegu, Republic of Korea) ,  Hussain Adil (Department of Agriculture, Abdul Wali Khan University, Mardan, Pakistan) ,  Mun Bong-Gyu (Laboratory of Plant Functional Genomics School of Applied Biosciences, Kyungpook National University, Daegu, Republic of Korea) ,  Lee Sang Uk (Laboratory of Plant Functional Genomics School of Applied Biosciences, Kyungpook National University, Daegu, Republic of Korea) ,  Asaf Sajjad (Chair of Oman’s Medicinal Plants and Marine Natural Products, University of Nizwa, Nizwa, Oman) ,  Ali Muhammad Amjad (Department of Plant Pathology and Center of Agriculture Biochemistry and Biotechnology University of Agriculture Faisalabad, Pakistan) ,  Lee In-Jung (School of Applied Biosciences, Kyungpook National University, Daegu, Republic of Korea) ,  Yun Byung-Wook (Laboratory of Plant Functional Genomics School of Applied Biosciences, Kyungpook National University, Daegu, Republic of Korea)
資料名： Environmental and Experimental Botany  (Environmental and Experimental Botany)
巻： 148  ページ： 128-143  発行年： 2018年 
JST資料番号： C0624A  ISSN： 0098-8472  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： WRKY転写因子は,通常,亜鉛フィンガーモチーフにより後に一または二個の保存されたWRKYドメイン(s)で特性づけられる重要な植物特異的調節遺伝子である。本研究ではArabidopsis thalianaを用いて,RNA-Seqベーストランスクリプトーム解析は一酸化窒素(NO)ドナーS-ニトロソシステイン(CySNO)への応答におけるWRKY TFをコードする三十三の遺伝子の差次的発現を示した。興味深いことに,これらのTFの93.9%が少なくとも2倍変化を伴うアップレギュレートされ,NO仲介遺伝子調節におけるそれらの推定関与を示唆した。全33トランスクリプトーム元素のGO解析は真菌病原体(89.39倍濃縮)に対する非生物的ストレス耐性と防御のような生物学的過程におけるそれらの推定される関与を示した。NO応答AtWRKY TFプロモーター領域の分析は,浸透圧ストレス応答,最大エリシタによって媒介される活性化,及び乾燥ストレス調節に関与するABRE,EIRE,ERE,MBSのようなシス作用要素の存在を明らかにした。イネ,ダイズおよびトマトオーソログとNO応答AtWRKY TFモチーフとの比較の解析は,同じグループに属するWRKYファミリーのメンバーは類似したモチーフと系統樹これらTFsは高度に保存されていることを示唆したを共有することを示唆した。定量的リアルタイムPCRによるトランスクリプトームデータの検証は,高い相関係数(0.85)双方の形式の解析の高い信頼性と類似性を示した。NO応答性および非応答性WRKYの比較はチロシンニトロ化とS-ニトロシル化を介してNOによる修飾のための潜在的な標的として役立つであろうWRKYGQKモチーフの7残基の距離でのチロシン(T)とシステイン(C)残基の存在を示した。機能変異体のatwrky62損失を用いたin vivo解析によるWRKYの応答を検証し,結果は,植物成長におけるAtWRKY62の負の役割を示した。atwrky62は,代謝におけるAtWRKY62の推定上の役割を示し,野生型植物に比べて,著しく少ないSNO含量を示した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： プロモーター領域 ,  遺伝的調節 ,  一酸化窒素 ,  *Arabidopsis ,  ダイズ ,  トランスクリプトーム ,  植物成長 ,  RNA【核酸】 ,  系統樹 ,  病原体 ,  *キャラクタリゼーション ,  野生型 ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  含硫アミノ酸 ,  第一アミン ,  アミノ酸 ,  フェノール類
準シソーラス用語： *WRKY蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Arabidopsis thaliana ,  遺伝子オントロジー ,  ニトロソ化ストレス ,  プロモーター解析 ,  qRT-PCR ,  RNA-Seq ,  WRKY

分類 (2件)： 植物生態学  (EE02000E) ,  植物に対する影響  (EE05030G)

物質索引 (2件)： システイン ,  チロシン

タイトルに関連する用語 (6件)： Arabidopsis ,  同定 ,  特性化 ,  NO ,  応答性 ,  WRKY転写因子