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J-GLOBAL ID：201802233649433054   整理番号：18A0805638

2つの主要な家畜化形質の比較トランスクリプトーム,メタボロミクス,解剖学的分析の比較:エンドウ(Pisum sp.)におけるさやの裂開と種子休眠【JST・京大機械翻訳】

A Combined Comparative Transcriptomic, Metabolomic, and Anatomical Analyses of Two Key Domestication Traits: Pod Dehiscence and Seed Dormancy in Pea (Pisum sp.)

著者 (19件)： Hradilova Iveta (Department of Botany, Palacky University in Olomouc) ,  Trneny Oldrich (Department of Plant Biology, Mendel University in Brno) ,  Trneny Oldrich (Agricultural Research, Ltd.) ,  Valkova Marketa (Department of Analytical Chemistry, Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Palacky University in Olomouc) ,  Valkova Marketa (Faculty of Science, Palacky University in Olomouc) ,  Cechova Monika (Department of Analytical Chemistry, Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Palacky University in Olomouc) ,  Cechova Monika (Faculty of Science, Palacky University in Olomouc) ,  Janska Anna (Department of Experimental Plant Biology, Charles University) ,  Prokesova Lenka (Department of Crop Science, Breeding and Plant Medicine, Mendel University in Brno) ,  Aamir Khan (Research Program-Genetic Gains, ICRISAT) ,  Krezdorn Nicolas (GenXPro) ,  Rotter Bjorn (GenXPro) ,  Winter Peter (GenXPro) ,  Varshney Rajeev K. (Research Program-Genetic Gains, ICRISAT) ,  Soukup Ales (Department of Experimental Plant Biology, Charles University) ,  Bednar Petr (Department of Analytical Chemistry, Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Palacky University in Olomouc) ,  Bednar Petr (Faculty of Science, Palacky University in Olomouc) ,  Hanacek Pavel (Department of Plant Biology, Mendel University in Brno) ,  Smykal Petr (Department of Botany, Palacky University in Olomouc)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 542  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 農業の起源は人間の歴史における転換点の1つであり,これの中心部は新しい植物形態の進化,家畜化作物である。種子の分散と発芽は,作物の栽培と収穫を容易にするために選択された2つの重要な形質である。本研究の目的は,種皮と豆莢の解剖学的構造を分析し,水不透過性種皮に関連する代謝化合物を同定し,エンドウ種子休眠と莢裂開に関与する特異的に発現した遺伝子を同定することであった。比較解剖学的,代謝学的およびトランスクリプトーム解析を,野生の休眠,dehiのPisum elaticus(JI64,VIR320)および栽培されているPisum sativumの非休眠(JI92,Careor)および組換え近交系(RILs)について実施した。種皮表面の組織,マクロ硬化物の長さ,および種皮の厚さにかなりの違いが見られた。組織化学的および生化学的分析により,遺伝子型に関連する遺伝子型の変化を示した。分離した種皮の液体クロマトグラフィー-エレクトロスプレイイオン化/質量分析及びレーザ脱離/イオン化質量分析は,非休眠遺伝子型と比較して,休眠におけるプロアントシアニジン(ガロカテキンの二量体及び三量体),クエルセチン及びミリセチン及びヒドロキシル化脂肪酸の有意に高い含量を明らかにした。高スループットRNA配列決定に結合したバルク集合分析は,休眠と非休眠種子またはdehiとindehiの間で,それぞれ770と148の差次的に発現した遺伝子の同定をもたらした。14の選択された細胞関連遺伝子の発現をqRT-PCRによって研究した。これらの中で,4つの遺伝子の発現パターン:ポリン(MACE-S082),ペルオキシソーム膜PEX14様蛋白質(MACE-S108),4-クマリン酸CoAリガーゼ(MACE-S131)およびUDP-グルコシルトランスフェラーゼ(MACE-S139)は,cDNA末端(MACE)データのMassive解析により全ての4つの遺伝子型で一致した。豆莢裂開の場合,2つの候補遺伝子(shatteringとSHATTERPR00F)の分析と20のMACE同定遺伝子(MACE-P004,MACE-P013,MACE-P015)の3つは,indehi遺伝子型の背側と腹側の鞘縫合における下方発現を示した。さらに,ペプチドグリカン結合ドメインまたはプロリンに富むエクステンシン様蛋白質の相同体であるMACE-P015は,PsLGIII上のDpo1遺伝子座を予測するために正確にマッピングされた。野生および栽培エンドウにおける種皮のこの統合分析は,新しい洞察を提供し,また,栽培化および種子休眠および莢裂開に関連する新しい疑問を提起する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結合部位 ,  RNA【核酸】 ,  種皮 ,  質量分析 ,  遺伝子型 ,  遺伝子 ,  代謝産物 ,  代謝 ,  発芽 ,  cDNA ,  *トランスクリプトーム ,  *エンドウ ,  *休眠 ,  脂肪酸
準シソーラス用語： 主要心血管イベント , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 家畜化 ,  マメ科 ,  エンドウ(Pisum sativum) ,  代謝物 ,  さやの裂開 ,  種子休眠 ,  種皮 ,  トランスクリプトーム

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： 家畜化 ,  形質 ,  トランスクリプトーム ,  メタボロミクス ,  解剖学 ,  分析 ,  エンドウ ,  Pisum ,  種子休眠