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J-GLOBAL ID：201802233748985566   整理番号：18A2115328

RNA配列特徴に基づく蛋白質コード化および長鎖非コード転写産物の比較分析【JST・京大機械翻訳】

Comparative analysis of protein-coding and long non-coding transcripts based on RNA sequence features

著者 (6件)： Volkova Oxana A. (Laboratory of Gene Engineering, The Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics, The Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Prosp. Acad. Lavrentyeva, 10, Novosibirsk 630090, Russia) ,  Kondrakhin Yury V. (Laboratory of Bioinformatics, Institute of Computational Technologies, The Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Ul. Acad. Rzhanova, 6, Novosibirsk 630090, Russia) ,  Kondrakhin Yury V. (BIOSOFT.RU, Ltd, Ul. Russkaya, 41/1 Novosibirsk 630058, Russia) ,  Kashapov Timur A. (BIOSOFT.RU, Ltd, Ul. Russkaya, 41/1 Novosibirsk 630058, Russia) ,  Sharipov Ruslan N. (BIOSOFT.RU, Ltd, Ul. Russkaya, 41/1 Novosibirsk 630058, Russia) ,  Sharipov Ruslan N. (Novosibirsk State University, Ul. Pirogova, 2, Novosibirsk 630090, Russia)
資料名： Journal of Bioinformatics and Computational Biology  (Journal of Bioinformatics and Computational Biology)
巻： 16  号： 2  ページ： 1840013  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1491A  ISSN： 0219-7200  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： シンガポール (SGP)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNAは細胞内細胞寿命と一般的に生物において重要な役割を果たしている。確立された蛋白質コードRNA(メッセンジャーRNA,mRNA)の他に,長い非コードRNA(lncRNA)は最近の研究者の注目を集めている。lncRNAは非コード化として分類されているが,いくつかの著者らはリボソームプロファイリングデータ(Ribo-seq)における対応する配列の存在を報告した。Ribo-seq技術は,細胞のRNA翻訳の特性化に利用される強力な実験ツールであり,開始(ハルリントニン,ラクタミドマイシン)および伸長(シクロヘキシミド)に焦点を合わせている。Ribo-seq実験から得られた翻訳を利用することにより,翻訳開始の予測のための新しい位置重み行列モデルを開発した。このモデルは,ヒトmRNAとlncRNAの間の識別の96%の精度を達成することを可能にした。RNAにおける推定ORFの予測に同じモデルを用いた場合,大部分のlncRNAはmRNAと対照的に小さなORF([数式:原文を参照] [数式:原文を参照] nt)のみを含むことを見出した。Copyright 2018 World Scientific Publishing Company All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 判別分析 ,  キャラクタリゼーション ,  mRNA ,  *RNA【核酸】 ,  *タンパク質 ,  長鎖 ,  アルゴリズム ,  ヒト
準シソーラス用語： 翻訳開始 ,  非翻訳長鎖RNA ,  非翻訳RNA ,  細胞寿命 ,  比較分析 ,  転写産物 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ヒトmRNA ,  ヒトLNRNA ,  小さいORF ,  判別分析 ,  位置重み行列アプローチ ,  IPSMatrixアルゴリズム

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： RNA ,  蛋白質 ,  長鎖 ,  転写産物 ,  比較分析