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J-GLOBAL ID：201802233850322220   整理番号：18A1392374

高密度SNPアレイに基づく中国のシンメンタール牛における父性に対する情報SNPsの選択と有効性【JST・京大機械翻訳】

Selection and effectiveness of informative SNPs for paternity in Chinese Simmental cattle based on a high-density SNP array

著者 (9件)： Zhang Tianliu (Laboratory of Molecular Biology and Bovine Breeding, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, PR China) ,  Guo Liping (Laboratory of Molecular Biology and Bovine Breeding, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, PR China) ,  Shi Mingyan (College of Life Science, Luoyang Normal University, Jiqing Road, 471934 Luoyang, PR China) ,  Xu Lingyang (Laboratory of Molecular Biology and Bovine Breeding, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, PR China) ,  Chen Yan (Laboratory of Molecular Biology and Bovine Breeding, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, PR China) ,  Zhang Lupei (Laboratory of Molecular Biology and Bovine Breeding, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, PR China) ,  Gao Huijiang (Laboratory of Molecular Biology and Bovine Breeding, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, PR China) ,  Li Junya (Laboratory of Molecular Biology and Bovine Breeding, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, PR China) ,  Gao Xue (Laboratory of Molecular Biology and Bovine Breeding, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, PR China)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 673  ページ： 211-216  発行年： 2018年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウシにおける不正確な父性割当は,遺伝的評価の精度に有意に影響を及ぼすことができる。ハイスループット技術における最近の進歩は,単一ヌクレオチド多型(SNP)マーカーの同定とそれらの濾過と個々の同定への応用を容易にした。著者らは,ボブドウSNP770K BeadChipを用いたゲノム選択のために,中国のSimmentalウシの参照集団から1074の雄牛を遺伝子型決定した。それらの間で,合計136の雄牛をランダムに選択して,Simmentalウシにおける父性試験のための適切な低密度SNPパネルを設計した。著者らの結果は,50のSNPが親試験における最も有益なマーカーであることを示し,未知の雌親事例におけるCPE(排除の累積確率)に対して99.89%の精度を有した。50の高度に有益なSNPマーカーは25の染色体にわたって分布し,染色体あたりの平均マーカー間距離は26.72Mbであった。平均マイナー対立遺伝子頻度(MAF),期待ヘテロ接合性(HE),および多型情報含有量(PIC)値は,それぞれ0.3748,0.4998,および0.4818であった。最終的に,50の同定されたSNPは,23の農場から1074の雄牛の残りの938のために父性を推定するために使用された。著者らの結果は,938の雄牛の76.75%が,95%の信頼性を有する家系に対して親子に割り当てられたことを明らかにした。そして,家系記録誤りの比率は,異なる群において9.52%-39.29%の範囲であった。著者らの研究は,中国のSimmentalウシにおける父性試験のための高密度SNPチップの応用を通して有益なマーカーの抽出に対する価値ある洞察を提供する最初の試みである。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *一塩基多型 ,  パネル ,  家系 ,  染色体 ,  農場 ,  *父親 ,  信頼性 ,  遺伝子頻度 ,  マイナ
準シソーラス用語： ヘテロ接合性 ,  低密度 ,  遺伝子タイピング ,  雄牛 ,  ハイスループット ,  *シンメンタール , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 父性割当 ,  情報的SNPs ,  中国の精神 ,  BovinesNP770K BeadChip

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： SNPアレイ ,  中国 ,  シンメンタール ,  牛 ,  父性 ,  SNPs ,  有効性