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J-GLOBAL ID：201802234416931875   整理番号：18A0492196

仮想スクリーニングと分子動力学シミュレーションを用いたCandida albicansの核Dam1複合体サブユニットAsk1に対する強力な阻害剤の同定【Powered by NICT】

Identification of potential inhibitors against nuclear Dam1 complex subunit Ask1 of Candida albicans using virtual screening and MD simulations

著者 (4件)： Tripathi Himanshu (Department of Metabolic & Structural Biology, CSIR-Central Institute of Medicinal & Aromatic Plants, P.O.-CIMAP, Kukrail Picnic Spot Road, Lucknow, 226015, Uttar Pradesh, India) ,  Tripathi Himanshu (Academy of Scientific & Innovative Research (AcSIR), CSIR-CIMAP Campus, CSIR-Central Institute of Medicinal & Aromatic Plants, P.O.-CIMAP, Lucknow, 226015, Uttar Pradesh, India) ,  Khan Feroz (Department of Metabolic & Structural Biology, CSIR-Central Institute of Medicinal & Aromatic Plants, P.O.-CIMAP, Kukrail Picnic Spot Road, Lucknow, 226015, Uttar Pradesh, India) ,  Khan Feroz (Academy of Scientific & Innovative Research (AcSIR), CSIR-CIMAP Campus, CSIR-Central Institute of Medicinal & Aromatic Plants, P.O.-CIMAP, Lucknow, 226015, Uttar Pradesh, India)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 72  ページ： 33-44  発行年： 2018年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 特異的標的に対するヒット化合物の同定は,創薬プログラムのための出発点を形成する。近年の新規化学物質(NCE)の一貫した低下傾向はリードに変換できる潜在的ヒット化合物,望ましい治療有効性と究極的には薬物を発見するための新しい方法を探索への挑戦を促した。公共データベースで利用可能なオミクスと活性データの膨大な量は新しい標的とその潜在的阻害剤を同定する機会を提供する。in silico法すなわち,化合物のクラスタリング,仮想スクリーニング,分子ドッキング,MDシミュレーションとMMPBSA計算技術の現状は,その構造が,現在の所,貫通アプローチによる予測のみおよび標的に対する潜在的「ヒット」を同定するためにパイプラインに採用した。本研究では,Candida albicansのDam1複合体サブユニットAsk1の可能な阻害剤の同定をもたらすことを引かき,PubChem化合物データベースから検索されたターゲットと化合物のアミノ酸配列から開始し,そのような方法でそれをモデル化した。も配位子ベースの結合部位決定手法を提案した。はC.albicansのDam1複合体のAsk1サブユニットの潜在的阻害剤,前有糸分裂相における早熟紡錘体伸長を防ぐために必要であることを同定した。提案方式はカンジダに対する他のユニークなターゲットの実質的に潜在的な阻害剤を見出すために役立つ可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *サブユニット ,  *鵞口瘡カンジダ ,  化学物質 ,  *計算機シミュレーション ,  結合部位 ,  有糸分裂 ,  アミノ酸配列 ,  モデリング ,  データベース
準シソーラス用語： 分子ドッキング ,  創薬 ,  *阻害剤 ,  *Dam1複合体 ,  *分子動力学シミュレーション ,  *バーチャルスクリーニング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 蛋白質モデリング ,  MM-PBSA ,  仮想スクリーニング ,  Dam1複合体 ,  分子ドッキング ,  抗真菌 ,  薬物

分類 (2件)： 抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (9件)： 仮想スクリーニング ,  分子動力学シミュレーション ,  Candida ,  核 ,  Dam1複合体 ,  サブユニット ,  ASK1 ,  阻害剤 ,  同定