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J-GLOBAL ID：201802234772820928   整理番号：18A0786353

Mycobacterium ulceransによりコロニー形成されたマウス皮膚組織からの細菌RNA抽出の最適化法【JST・京大機械翻訳】

An Optimized Method for Extracting Bacterial RNA from Mouse Skin Tissue Colonized by Mycobacterium ulcerans

著者 (9件)： Robbe-Saule Marie (Center for Research in Cancerology and Immunology Nantes-Angers, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Universite de Nantes, Universite d’Angers) ,  Robbe-Saule Marie (Equipe Atip-Avenir, Center for Research in Cancerology and Immunology Nantes-Angers, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Centre Hospitalier Universitaire et Universite d’Angers) ,  Babonneau Jeremie (Center for Research in Cancerology and Immunology Nantes-Angers, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Universite de Nantes, Universite d’Angers) ,  Babonneau Jeremie (Equipe Atip-Avenir, Center for Research in Cancerology and Immunology Nantes-Angers, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Centre Hospitalier Universitaire et Universite d’Angers) ,  Sismeiro Odile (Transcriptome and Epigenome Platform, Biomics, Center for Innovation and Technological Research, Institut Pasteur) ,  Marsollier Laurent (Center for Research in Cancerology and Immunology Nantes-Angers, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Universite de Nantes, Universite d’Angers) ,  Marsollier Laurent (Equipe Atip-Avenir, Center for Research in Cancerology and Immunology Nantes-Angers, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Centre Hospitalier Universitaire et Universite d’Angers) ,  Marion Estelle (Center for Research in Cancerology and Immunology Nantes-Angers, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Universite de Nantes, Universite d’Angers) ,  Marion Estelle (Equipe Atip-Avenir, Center for Research in Cancerology and Immunology Nantes-Angers, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Centre Hospitalier Universitaire et Universite d’Angers)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 512  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 宿主コロニー形成中の細菌トランスクリプトーム解析は,細菌とその宿主の間の関係の複雑さを解読するために不可欠である。RNA配列決定(RNA-seq)は,細菌適応,宿主応答,およびいくつかの場合において,Mycobacterium ulcerans感染の状況で最近観察されたように,クロストークの基礎となる相互耐性に関する価値ある情報を提供する有望なアプローチである。Buruli潰瘍はM.潰瘍によって引き起こされる。この無視された疾患は世界中で最も一般的なマイコバクテリア病である。治療なしで,M.潰瘍は大量の皮膚潰瘍を引き起こす。治癒過程は,疾患開始後数か月のBuruli潰瘍患者の5%で観察される可能性がある。この自発的治癒過程は,いくつかの宿主がM.潰瘍によって引き起こされた病変の発生に対抗できることを示唆する。このプロセスに含まれる機構を解読することは,新しい処理の可能性を開くはずである。この目的のために,著者らは最近,自然治癒過程の研究のための最初のマウスモデルを開発した。著者らは,治癒過程が細菌とその宿主の間の相互耐性に基づいていることを示した。この文脈において,RNA-seqは細菌適応を解読するための最も適切な方法であると思われる。しかし,宿主組織における低い細菌負荷のために,RNA-seq分析のための皮膚組織からのマイコバクテリアRNAの分離は依然として困難なままである。試料中の宿主RNAの量を最小化しながら,マイコバクテリアRNAを抽出し精製する方法を開発した。このアプローチは,示差溶解法による細菌RNAの抽出に基づいた。この方法の開発における挑戦は,細菌細胞に対する損傷なしに宿主RNAの除去に好都合な溶解システムの選択であった。この目的を達成するために,M.潰瘍の厚い抵抗性細胞壁を用いた。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *細菌 ,  感染 ,  皮膚潰瘍 ,  *RNA【核酸】 ,  治癒 ,  *Mycobacterium ,  細胞壁 ,  潰瘍 ,  患者 ,  *最適化
準シソーラス用語： RNA-seq ,  トランスクリプトーム解析 ,  *細菌RNA ,  *コロニー形成 ,  *Mycobacterium ulcerans , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNA精製 ,  RNA-seq ,  Mycobacterium ulcerans ,  クロストーク ,  宿主-細菌相互作用

分類 (3件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  皮膚の基礎医学  (GF01020Y) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

タイトルに関連する用語 (6件)： Mycobacterium ,  コロニー形成 ,  マウス ,  皮膚組織 ,  細菌RNA ,  最適化