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J-GLOBAL ID：201802235011195570   整理番号：18A0805726

トランスクリプトーム比較は2つの密接に関連したIlex種におけるトリテルペノイド生合成の候補遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic Comparison Reveals Candidate Genes for Triterpenoid Biosynthesis in Two Closely Related Ilex Species

著者 (9件)： Wen Lingling (Key Laboratory of Chinese Medicinal Resource from Lingnan, Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine) ,  Yun Xiaoyun (Key Laboratory of Chinese Medicinal Resource from Lingnan, Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine) ,  Zheng Xiasheng (Zhongshan Zhongzhi Pharmaceutical Group, Key Laboratory for Technologies and Applications of Ultrafine Granular Powder of Herbal Medicine, State Administration of Traditional Chinese Medicine) ,  Xu Hui (Key Laboratory of Chinese Medicinal Resource from Lingnan, Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine) ,  Zhan Ruoting (Key Laboratory of Chinese Medicinal Resource from Lingnan, Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine) ,  Chen Weiwen (Key Laboratory of Chinese Medicinal Resource from Lingnan, Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine) ,  Xu Yaping (Key Laboratory of Chinese Medicinal Resource from Lingnan, Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine) ,  Chen Ye (Key Laboratory of Chinese Medicinal Resource from Lingnan, Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine) ,  Zhang Jie (Key Laboratory of Chinese Medicinal Resource from Lingnan, Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 634  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 中国南部,Ilex pubescensおよびIlex asprelaは,伝統的な漢方薬において頻繁に使用されている。それらの両者は,異なる薬理効果を有することが示されている種々のウルサン型トリテルペノイドサポニンを産生する。しかし,その生合成についてはほとんど知られていない。本研究において,I.pubescensのトランスクリプトーム解析とその密接に関連する種I.asprelaとの比較を行い,トリテルペノイドサポニン生合成に関与する可能性のある遺伝子を同定した。I.pubescensのRNA配列決定(RNA-seq)とde novoトランスクリプトーム集合を通して,全部で68,688のUnigeneクラスタを得て,それらの32,184(46.86%)を主要な公開データベース(NCBI,Swiss-Prot,KEGG)の配列との比較によって成功裏に注釈した。それは,トリテルペノイドバックボーン生合成に関連する128のUniGen,11のOSC(オキシドスクアレンシクラーゼ),233のCYPs(チトクロームP450),および269のUGT(UDP-グリコシルトランスフェラーゼ)を含む。トリテルペノイドサポニン生合成に関与する良く特性化された遺伝子による相同性ベースの芽と系統発生分析により,5つのOSCs,14のCYPs,および1つのUGTが,最も有望な候補遺伝子としてさらに提案されている。blastpとOrthMCL法を用いた2つのIlex種間のトランスクリプトーム比較により,高い配列類似性を明らかにした。大部分のCYPsと同様にすべてのOSCとUGTはオーソログ遺伝子として分類され,一方,I.pubescensにおける5つのCYPsとI.asprelaにおける3つのCYPsは種特異的である。IpAS1と命名されたOSC候補の1つを成功裏にクローン化し,Saccharomyces cerevisiae INVSc1で発現させた。ガスクロマトグラフィー(GC)とガスクロマトグラフィー-質量分析(GC-MS)による酵母抽出物の分析は,IpAS1が混合アミリンシンターゼであり,α-アミリンとβ-アミリンを5:1の比率で生産することを示し,それはI.asprelaからのオーソログIaAS1と類似している。本研究は,I.pubescensのトランスクリプトームをプロファイル化する最初の調査であり,生成データと遺伝子モデルは,この植物における生理学と代謝に関するさらなる分子研究を容易にする。比較トランスクリプトーム解析により,トリテルペノイドサポニンの生合成経路に関与する一連の候補遺伝子を同定し,トランスクリプトームレベルでのそれらの生合成への新しい洞察を提供した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Saccharomyces cerevisiae ,  キャラクタリゼーション ,  GC-MS分析 ,  *遺伝子 ,  *生合成 ,  RNA【核酸】 ,  チトクロームP450 ,  *トリテルペン ,  クローン ,  *トランスクリプトーム ,  薬理作用 ,  相同性
準シソーラス用語： 生合成経路 ,  トランスクリプトーム解析 ,  トリテルペノイドサポニン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： Ilex pubescens ,  トランスクリプトーム ,  トリテルペノイドサポニン ,  生合成 ,  トランスクリプトーム比較 ,  遺伝子同定 ,  オキシドスクアレンシクラーゼ ,  Ilex Aspellilla

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (4件)： トランスクリプトーム ,  トリテルペノイド ,  生合成 ,  候補遺伝子