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J-GLOBAL ID：201802235113401804   整理番号：18A0125975

単一細胞系統樹の統計的解析について【Powered by NICT】

On the statistical analysis of single cell lineage trees

著者 (4件)： Stadler Tanja (Department of Biosystems Science & Engineering (D-BSSE) Mattenstrasse 26, Basel 4058, Switzerland) ,  Skylaki Stavroula (Department of Biosystems Science & Engineering (D-BSSE) Mattenstrasse 26, Basel 4058, Switzerland) ,  D. Kokkaliaris Konstantinos (Department of Biosystems Science & Engineering (D-BSSE) Mattenstrasse 26, Basel 4058, Switzerland) ,  Schroeder Timm (Department of Biosystems Science & Engineering (D-BSSE) Mattenstrasse 26, Basel 4058, Switzerland)
資料名： Journal of Theoretical Biology  (Journal of Theoretical Biology)
巻： 439  ページ： 160-165  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0288B  ISSN： 0022-5193  CODEN： JTBIA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 幹細胞は多細胞生物の再生と修復において中心的役割を果たす。しかし,確実にそれらを同定するための自明から遠く離れたままである。数十年の研究にもかかわらず,細胞表面マーカーに基づく造血幹細胞(HSC)を単離する現在の技術は50%純度をもたらし,すなわち機能的に試験した場合,選別細胞の半分は幹細胞ではない。最新顕微鏡技術はin vitroで週までの単一細胞とその子孫を追跡することを可能にし,個々の細胞の細胞運命と寿命を記録した。細胞追跡は,いわゆる系統樹を生成する。ここでは,系統樹における初期細胞はH SCが存在するかどうか決定するために統計的手法を提案した。マウス造血系統樹にこれらの技術を適用し,我々のHSCデータセットにおける樹木の18%は独特の特徴を示すことを明らかにし,この特徴は真の幹細胞から開始しこれらの木と互換性がある。50%純度HSC経験的データセットのを仮定すると,これは試験の0.35乗に対応し,1型誤差は0.047と推定された。要約すると,本研究は,系統樹の統計的分析は,細胞の分類,現在バイオマーカーのみに基づいて行われるを改善できることを示した。著者らの統計的手法は,哺乳類幹細胞生物学に限定されない。単一細胞系統樹,多細胞生物における細菌,単細胞真核生物,あるいは単一細胞からの任意の型を調べることができる。これは単一細胞レベルでの細胞動力学に影響する分子のより良い理解に寄与すると期待される。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *統計解析 ,  単離 ,  造血幹細胞 ,  真核生物 ,  造血 ,  統計的方法 ,  バイオマーカー ,  幹細胞 ,  細菌 ,  *系統樹 ,  純度 ,  哺乳類
準シソーラス用語： 細胞運命 ,  多細胞生物 ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 幹細胞 ,  単一細胞分析 ,  時間lapseバイオイメージング ,  尤度 ,  ブートストラップ

分類 (1件)： 造血系  (EJ07020Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 単一細胞 ,  系統樹 ,  統計的解析