文献

J-GLOBAL ID：201802235264493412   整理番号：18A0884876

plaAおよびplaSのバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis of plaA and plaS in Serratia marcescens

著者 (10件)： Wang Ying (安徽師范大学生命科学学院生物信息研究所,蕪湖241000;安徽工程大学生物与化学工程学院,蕪湖241000) ,  Wang Zhou (安徽工程大学生物与化学工程学院,蕪湖,241000) ,  Zhang Qin (安徽師范大学生命科学学院生物信息研究所,蕪湖,241000) ,  Wang Qingqing (安徽師范大学生命科学学院生物信息研究所,蕪湖,241000) ,  Jiang Lan (安徽師范大学生命科学学院生物信息研究所,蕪湖,241000) ,  Wu Xuan (安徽師范大学生命科学学院生物信息研究所,蕪湖,241000) ,  Ding Hengwu (安徽師范大学生命科学学院生物信息研究所,蕪湖,241000) ,  Liu Birong (安徽師范大学生命科学学院生物信息研究所,蕪湖,241000) ,  Xue Zhenglian (安徽工程大学生物与化学工程学院,蕪湖,241000) ,  Han Xianzhao (安徽師范大学生命科学学院生物信息研究所,蕪湖,241000)
資料名： Shengwu Xue Zazhi  (Shengwu Xue Zazhi)
巻： 34  号： 6  ページ： 1-6,12  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2987A  ISSN： 2095-1736  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ホスホリパーゼA1はリン脂質を加水分解する酵素であり、バイオインフォマティクス法を利用してホスホリパーゼA1遺伝子及び補助タンパク質遺伝子を分析し、ホスホリパーゼのさらなる研究に基礎を築いた。プラスミドplaA(PhospholipaseA1)とplaS(accessoryprotein)のクローニングとシークエンシングを行い、その核酸配列とアミノ酸配列の特徴を分析し、そのタンパク質の二次構造、三次構造に対して予測を行い、同時にML、MPとBIの3種類の方法を用いて、系統樹を構築した。その結果,plaSのdN/dS値はplaAより高く,PlaA蛋白質及びPlaS蛋白質の二次構造はαヘリックス及びランダムコイルを主とし,plaA及びplaSの二次構造は16S単独構築のものより高いことを示した。.plaA及びPlaS蛋白質の二次構造は16S単独のものに比べて高かった(plaA,plaS,plaS,plaS,plaS,plaS,plaS,plaS,plaS,plaS)。plaA、plaSと16Sの3つの遺伝子の連合によって構築した系統樹の中で、UreatophthorasolaniとS.maltophiliaはともに粘質砂雷菌と一本で、親縁関係で、この2種類のセラチア菌はおそらく粘質砂雷菌より接近した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ホスホリパーゼA1 ,  タンパク質 ,  リン脂質 ,  粘性 ,  プラスミド ,  Serratia ,  *二次構造 ,  アミノ酸配列 ,  系統樹 ,  ヌクレオチド配列 ,  遺伝子 ,  三次構造 ,  ホスホリパーゼ
準シソーラス用語： αヘリックス ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： phospholipase A1 ,  accessory protein gene plaS ,  Serratia ,  phylogeny

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (1件)： バイオインフォマティクス解析