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J-GLOBAL ID：201802235315650618   整理番号：18A1740543

ピーナッツFAD遺伝子ファミリーの全ゲノム同定と発現パターン分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Expression Pattern Analysis of Peanut FAD Gene Family

著者 (7件)： Ruan Jian (山東省農業科学院生物技術研究中心/山東省作物遺伝改良与生態生理重点実験室,山東 済南,250100) ,  Dan Lei (山東省農業科学院生物技術研究中心/山東省作物遺伝改良与生態生理重点実験室,山東 済南,250100) ,  Li Xinguo (山東省農業科学院生物技術研究中心/山東省作物遺伝改良与生態生理重点実験室,山東 済南,250100) ,  Guo Feng (山東省農業科学院生物技術研究中心/山東省作物遺伝改良与生態生理重点実験室,山東 済南,250100) ,  Meng Jingjing (山東省農業科学院生物技術研究中心/山東省作物遺伝改良与生態生理重点実験室,山東 済南,250100) ,  Wan Shubo (山東省農業科学院,山東 済南,250100) ,  Peng Zhenying (山東省農業科学院生物技術研究中心/山東省作物遺伝改良与生態生理重点実験室,山東 済南,250100)
資料名： Shandong Nongye Kexue  (Shandong Nongye Kexue)
巻： 50  号： 6  ページ： 1-9  発行年： 2018年 
JST資料番号： C3697A  ISSN： 1001-4942  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 脂肪酸デサチュラーゼ(FAD)は不飽和脂肪酸合成の鍵酵素であり、植物が各生命活動を維持し、生物と非生物ストレスに重要な役割を持つ。本研究では、ピーナッツゲノム中のFAD遺伝子ファミリーに対して鑑定とバイオインフォマティクス分析を行い、ピーナッツトランスクリプトームデータを利用して、ピーナッツFAD(AhFAD)遺伝子の発現パターン及び可変スプライシング形式について分析を行った。結果は,31のAhFAD遺伝子が,6つの型,AhSAD遺伝子の12の配列,AhFAD2の6つの配列,AhFAD3の4つの配列,AhFAD4/5の3つの配列,AhFAD6の2つの配列,およびAhFAD6の2つの配列を含むことを示した。AhFAD7/8は4つの配列を持っていた。クラスター分析により、AhFADは2大分枝がある:遊離AhSAD分枝と膜結合AhFAD分枝、膜結合AhFAD分枝中AhFAD4/5起源が一番早く、ω-3AhFADはω-6AhFADから進化し、単双子葉は異なる分枝にクラスタ化する。発現パターン分析により、AhSAD、AhFAD2とAhFAD3は種子中の発現レベルが高く、AhFAD4/5、AhFAD6、AhFAD7/8は葉において発現量が最も高いことが分かった。可変スプライシング分析により、AhFADサブファミリー間の可変スプライシング形式の差異が明らかで、そのうち12個のAhFAD遺伝子に可変スプライシングが発生した。TTSとTSSは最大の可変スプライシングイベントであり,次いでIRで,AEとESは最少であった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  脂肪酸デサチュラーゼ ,  *遺伝子 ,  トランスクリプトーム ,  *ナンキンマメ ,  不飽和脂肪酸 ,  クラスタ分析 ,  双子葉植物 ,  クラスタ化 ,  酵素
準シソーラス用語： 膜結合 ,  バイオインフォマティクス ,  非生物的ストレス ,  *遺伝子発現パターン ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Peanut ,  Fatty acid desaturase (FAD) ,  Bioinformatics analysis ,  Expression pattern ,  Alter-native splicing

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (7件)： ピーナッツ ,  FAD ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  発現 ,  パターン分析