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J-GLOBAL ID:201802236399864293   整理番号:18A1859519

Gibbsエネルギー動的収率法(GEDYM):エネルギー制限条件下での微生物増殖収率の予測【JST・京大機械翻訳】

Gibbs Energy Dynamic Yield Method (GEDYM): Predicting microbial growth yields under energy-limiting conditions
著者 (2件):
資料名:
巻: 241  ページ: 1-16  発行年: 2018年 
JST資料番号: C0062A  ISSN: 0016-7037  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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Biomass陽的生物地球化学モデルは,実験室で測定された値を用いて微生物増殖収率(Y)を割り当て,熱力学ベースの方法を用いて予測される。しかし,Y値は低エネルギー供給条件下ではほとんど測定されない。これはしばしば表面下で支配され,異化エネルギー供給速度が制限されたときのY値を計算するための既存の予測法はほとんど試験されていない。ここでは,Y値を計算するための新しい半理論的方法を導き,検証した。方法の検証は,主に(60%)低エネルギー(>-25kJ(mol e-)~-1)代謝を含む132の地球化学的に関連する文献Y値の編集に依存する。GEDYMは代謝反応(ΔGet)のGibbsエネルギー変化を推定することに基づいており,それはその成長収率を通して微生物の異化(ΔGcat)と同化(ΔGan)反応のGibbsエネルギー変化を結び付ける。ΔGet,ΔGcatおよびΔGanの値がそれぞれの反応指数に依存することを考えると,得られたY値は細胞を囲む化学環境の変化を説明する。GEDYMは,ΔGetがΔGcatとその対応する標準状態値の間の相対差からその標準状態値から逸脱する程度を正確に推定する経験的関係を組み込んだ。GEDYMは,既存のGibbsエネルギー散逸法(GEDM)よりも低い相対誤差と統計的バイアスをもつY値をもたらす。非類似鉄還元,硫酸塩還元及びメタン生成を例として用いて,個々の代謝に対するY値を予測するときのΔGcat及びΔGanの変動を考慮することの重要性を示した。変動する地球化学的条件に対するΔGetとYの値を動的に調整する能力のため,GEDYMは予測反応性輸送モデルにおける地球微生物活性のより現実的な表現をもたらす。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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同位体地質学 

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