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J-GLOBAL ID：201802236666041602   整理番号：18A0965569

Lactococcus lactis分類群の比較と機能ゲノミクス;進化とニッチ適応への洞察【JST・京大機械翻訳】

Comparative and functional genomics of the Lactococcus lactis taxon; insights into evolution and niche adaptation

著者 (7件)： Kelleher Philip (School of Microbiology, University College Cork, Cork, Ireland) ,  Bottacini Francesca (Alimentary Pharmabiotic Centre, University College Cork, Cork, Ireland) ,  Mahony Jennifer (School of Microbiology, University College Cork, Cork, Ireland) ,  Mahony Jennifer (Alimentary Pharmabiotic Centre, University College Cork, Cork, Ireland) ,  Kilcawley Kieran N. (Department of Food Biosciences, Teagasc Food Research Centre, Cork, Ireland) ,  Sinderen Douwe van (School of Microbiology, University College Cork, Cork, Ireland) ,  Sinderen Douwe van (Alimentary Pharmabiotic Centre, University College Cork, Cork, Ireland)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 267  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:Lactococcus lactisは,チーズ生産におけるスターターカルチャーとして利用されている酪農産業への安全な使用と経済的重要性の長い歴史のために,最も広く研究されている乳酸菌種の中にある。【結果】現在の研究において,16のL.lactis亜種lactisとL.lactis亜種クレモリスゲノムの完全な配列決定について報告する。14の完全に配列決定された,公開されて入手可能なLactococcus染色体と結合したこれらの16のL.lactis株の染色体特徴を,L.lactis亜種分割,進化およびニッチ適応を識別することに重点を置いて評価した。L.lactisの推定汎ゲノムは閉鎖されていることが分かり,この分析に用いた代表的データセットが分類群の遺伝的多様性を完全に記述するのに十分であることを示した。【結論】Niche適応は,各L.lactis亜種の遺伝的含有量の支配において有意な役割を果たすように見えるが,一方,酪農ニッチにおける(差動的)ゲノム崩壊および冗長性も強調される。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 冗長性 ,  スターターカルチャー ,  酪農 ,  染色体 ,  *Lactococcus ,  安全性 ,  遺伝 ,  *乳酸連鎖球菌 ,  乳酸菌 ,  ゲノム
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  亜種 ,  *ニッチ ,  *機能ゲノミクス ,  *分類群 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Lactococcus lactis ,  ゲノミクス ,  SMRTシークエンシング ,  汎ゲノム ,  ニッチ適応

分類 (2件)： チーズ  (FJ12025C) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

引用文献 (73件)：

• Syst Appl Microbiol; Molecular and chemotaxonomic approaches to the classification of streptococci, enterococci and lactococci: a review; K Schleifer, R Kilpper-Bälz; 10; 1987; 1-19; 10.1016/S0723-2020(87)80002-4; CR1;
• Int J Syst Evol Microbiol; Lactobacillus hordniae, a New Species from the Leafhopper (Hordnia circellata); BA Latorre-Guzman, CI Kado, RE Kunkee; 27; 1977; 362-370; CR2;
• Int J Syst Evol Microbiol; Lactococcus lactis subsp. tructae subsp. nov. isolated from the intestinal mucus of brown trout (Salmo trutta) and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss); T Perez, JL Balcazar, A Peix, A Valverde, E Velazquez, I Blas, I Ruiz-Zarzuela; 61; 2011; 1894-1898; 10.1099/ijs.0.023945-0; CR3;
• FEMS Microbiol Rev; The Lactococcus lactis plasmidome: much learnt, yet still lots to discover; S Ainsworth, S Stockdale, F Bottacini, J Mahony, D Sinderen; 38; 2014; 1066-1088; 10.1111/1574-6976.12074; CR4;
• Nucleic Acids Res; Analysis of six prophages in Lactococcus lactis IL1403: different genetic structure of temperate and virulent phage populations; A Chopin, A Bolotin, A Sorokin, SD Ehrlich, MC Chopin; 29; 2001; 644-651; 10.1093/nar/29.3.644; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： Lactococcus ,  分類 ,  機能ゲノミクス ,  進化 ,  ニッチ ,  適応 ,  洞察