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J-GLOBAL ID：201802236753091938   整理番号：18A0139286

時変指向性遺伝子調節ネットワークの推定【Powered by NICT】

Estimating time-varying directed gene regulation networks

著者 (3件)： Nie Yunlong (Department of Statistics and Actuarial Science, Simon Fraser University, British Columbia, Canada) ,  Wang LiangLiang (Department of Statistics and Actuarial Science, Simon Fraser University, British Columbia, Canada) ,  Cao Jiguo (Department of Statistics and Actuarial Science, Simon Fraser University, British Columbia, Canada)
資料名： Biometrics  (Biometrics)
巻： 73  号： 4  ページ： 1231-1242  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0071A  ISSN： 0006-341X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子ネットワーク内の動的調節プロセスをモデル化する問題は長い間大きな関心を集めている。多数の非線形常微分方程式(ODE)の調節機能は,パラメトリック仮定なしにデータから直接推定したこの動的システムをモデル化するために提案した。ほとんどの現行の研究は遺伝子調節ネットワークは静的仮定しているが,実際には,ネットワークの接続と調節機能は時間または環境によって変化する。調節は起こらないとすれば,この変化は遺伝子発現で変化する調節機能を可能にし,零とこの調節機能を強制することによって,この動力学的モデルに反映された。機能SCADは調節機能の滑らかな推定を提供すると調節効果は存在しない区間を同定するために,と同時に,時変スパースおよび有向遺伝子調節ネットワークを推定すると呼ばれる統計的方法を導入した。提案法の有限サンプル性能をモンテカルロシミュレーションで調べた。著者らの方法は,Drosophila melanogaster(キイロショウジョウバエ)のはい段階過程での筋発生に関与する20個の遺伝子の時間変化を標的とした遺伝子調節ネットワークを推定することにより実証した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ショウジョウバエ ,  統計的方法 ,  遺伝子発現 ,  *遺伝子 ,  経時変化 ,  動的系 ,  力学モデル ,  *ネットワーク ,  モデリング ,  常微分方程式 ,  筋形成
準シソーラス用語： キイロショウジョウバエ ,  モンテカルロシミュレーション ,  遺伝子ネットワーク ,  *遺伝子調節ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 常微分方程式 ,  平滑化スプライン ,  スパース推定 ,  システム同定

分類 (2件)： 昆虫・ダニによる植物被害  (FC04072U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 時 ,  指向性 ,  遺伝子調節ネットワーク ,  推定