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J-GLOBAL ID：201802236882484207   整理番号：18A0844416

リケッチアの系統学における新しいアプローチ【JST・京大機械翻訳】

New approaches in the systematics of rickettsiae

著者 (5件)： Shpynov S.N. (N.F. Gamaleya NRCEM, Moscow, Russia) ,  Fournier P.-E. (UMR VITROME, Aix-Marseille Universite, IRD, Service de Sante des Armees, Assistance Publique-Hopitaux de Marseille, Institut Hospitalo-Universitaire Mediterranee-Infection, Marseille, France) ,  Pozdnichenko N.N. (OmSTU, Omsk, Russia) ,  Gumenuk A.S. (OmSTU, Omsk, Russia) ,  Skiba A.A. (OmSTU, Omsk, Russia)
資料名： New Microbes and New Infections  (New Microbes and New Infections)
巻： 23  ページ： 93-102  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2902A  ISSN： 2052-2975  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 形式的次数分析(FOA)の開発により,Rickettssiaceaeファミリー代表の49ゲノムの分類を構築することができた。最近,FOAは,リケッチアゲノムの構造のより深い研究のために,遺伝子の新しいツール,「類似性のマトリックス」および「低感度なハッシング」により拡張されている。新しい分類は,Rickettsia africae strの位置を決定することにより,以前に構築されたものを確認し,補足した。ESF-5,R.heilongjiangensis 054,R.monacensis str.IRR/Munich,R.montanensis str.OSU85-930,R.raoultii str.Khabarovsk,R.rhiicephali str.3-7-female6-CWPPとRickettsiales bacterium str.Ac37b。遺伝子のマップは,完全なゲノムとそれらの成分を図式型で示した。類似性の「マトリックス」を,種R.rickettsii(11株)とR.prowazekii(10株)内の株の亜分類的カテゴリーへの徹底的分類に適用した。類似性の「マトリックス」は,それらの成分の対比較により完全ゲノムの相同性の程度を決定し,ヌクレオチド配列において同一で類似している。FOAツールの開発と応用を通して,完全なゲノムとそれらの成分の研究のための新しい遺伝子体系的アプローチを提案した。その応用には,完全なゲノムの分析とそれらのアノテーションに基づいて,微生物の分類のための原理の開発が含まれている。このアプローチは,世界中の節足動物において多数存在するいくつかのCandiidatus Rickettsia spp.の分類学的分類と特性化に役立つ可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 節足動物 ,  ハッシング ,  相同性 ,  類似性 ,  *リケッチア類 ,  キャラクタリゼーション ,  リケッチア目 ,  リケッチア属 ,  アノテーション ,  ゲノム ,  病原性 ,  遺伝子 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： 分類学 ,  *系統学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： 節足動物 ,  生態学 ,  疫学 ,  形式的順序解析 ,  ゲノム ,  ゲノム分類学 ,  リケッチア ,  リケッチア症 ,  系統学 ,  病原性

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (2件)： リケッチア ,  系統学