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J-GLOBAL ID：201802236937212824   整理番号：18A0973927

マウス骨髄由来マクロファージの時間経過LPS刺激後の遺伝子発現レベルの正常化のための信頼できる参照遺伝子の選択【JST・京大機械翻訳】

Selection of reliable reference genes for the normalisation of gene expression levels following time course LPS stimulation of murine bone marrow derived macrophages

著者 (6件)： Tanaka Akane (The School of Life Sciences, University of Technology Sydney, Ultimo, Australia) ,  To Joyce (The School of Life Sciences, University of Technology Sydney, Ultimo, Australia) ,  O’Brien Bronwyn (The School of Life Sciences, University of Technology Sydney, Ultimo, Australia) ,  O’Brien Bronwyn (The Centre for Health Technologies, University of Technology Sydney, Ultimo, Australia) ,  Donnelly Sheila (The School of Life Sciences, University of Technology Sydney, Ultimo, Australia) ,  Lund Maria (The School of Life Sciences, University of Technology Sydney, Ultimo, Australia)
資料名： BMC Immunology (Web)  (BMC Immunology (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 43  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7306A  ISSN： 1471-2172  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】マクロファージは,先天性および適応性免疫反応の両方の開始,持続および調節における重要な役割を果たしている。これらは,特にサイトカインをコードする遺伝子の発現の調節を介してこれらの役割を果たす。マウス骨髄由来マクロファージ(BMDM)は,炎症誘発性刺激,特にリポ多糖類(LPS)に対する免疫応答の研究のためのモデルマクロファージ集団として一般的に使用されており,ヒトの状況に関連している可能性がある。LPS刺激マクロファージの時間的応答の評価は,RT-qPCRによる遺伝子発現レベルの測定を介して広く行われている。遺伝子発現レベルのロバストで高感度な測定を提供する一方,RT-qPCRは遺伝子発現データの安定発現参照遺伝子への正規化に依存する。一般的に,正規化遺伝子(s)は,研究の特定の実験条件下での発現安定性を検証することなく,「伝統的」参照遺伝子のリストから選択される。そのような検証の欠如において,多くの研究が単一参照遺伝子のみを使用するということにより,データの信頼性は疑問である。【結果】8つの一般的に使用される参照遺伝子の発現レベルの安定性を,LPSに対するBMDM応答のピーク(6時間)と分解能(24時間)の間に評価した。さらに,この研究は,特定の「伝統的」参照遺伝子がLPS曝露によって実際に制御され,したがって,それらの包含がデータ解釈の精度を損なう可能性があることを示した。この研究は,不安定な参照遺伝子を用いた遺伝子発現データの正規化が得られた実験データに大きく影響し,したがって,最終的な生物学的結論が引き出されることを示す。結論:本研究は,個々の実験条件に対する参照遺伝子安定性の検証の重要性を再確認する。LPS刺激マクロファージにおける遺伝子発現レベルは,ヒトの状態に関連する生物学的現象を推論するために日常的に使用されることから,参照遺伝子発現安定性の検証が重要である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 正規化 ,  定量的PCR法 ,  ロバスト性 ,  炎症 ,  高感度 ,  ヒト ,  リポ多糖類 ,  分解能 ,  *遺伝子 ,  *遺伝子発現 ,  免疫反応 ,  信頼性 ,  *マクロファージ
準シソーラス用語： *参照遺伝子 ,  *骨髄マクロファージ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： マクロファージ ,  リポ多糖 ,  炎症誘発反応 ,  RT-QPCR ,  参照遺伝子

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (43件)：

• Nat Rev Immunol; Protective and pathogenic functions of macrophage subsets; PJ Murray, TA Wynn; 11; 2011; 723-737; 10.1038/nri3073; CR1;
• Sci Rep; Age-associated metabolic dysregulation in bone marrow-derived macrophages stimulated with lipopolysaccharide; F Fei, KM Lee, BE McCarry, DME Bowdish; 6; 2016; 22637; 10.1038/srep22637; CR2;
• FASEB J; Abolition of mitochondrial substrate-level phosphorylation by itaconic acid produced by LPS-induced Irg1 expression in cells of murine macrophage lineage; B Németh, J Doczi, D Csete, G Kacso, D Ravasz, D Adams, G Kiss, AM Nagy, G Horvath, L Tretter; 1; 2016; 286-300; 10.1096/fj.15-279398; CR3;
• Sci Rep; Methane limit LPS-induced NF-κB/MAPKs signal in macrophages and suppress immune response in mice by enhancing PI3K/AKT/GSK-3β-mediated IL-10 expression; X Zhang, N Li, H Shao, Y Meng, L Wang, Q Wu, Y Yao, J Li, J Bian, Y Zhang, X Deng; 6; 2016; 29359; 10.1038/srep29359; CR4;
• J Immunol; Lipopolysaccharide-induced macrophage inflammatory response is regulated by SHIP; H Fang, RA Pengal, X Cao, LP Ganesan, MD Wewers, CB Marsh, S Tridandapani; 173; 1; 2004; 360-366; 10.4049/jimmunol.173.1.360; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： マウス ,  骨髄由来マクロファージ ,  時間経過 ,  LPS ,  刺激 ,  遺伝子発現 ,  信頼 ,  参照遺伝子