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J-GLOBAL ID：201802237005161562   整理番号：18A0788090

細菌の必須遺伝子を同定し予測するためのオンライン資源の包括的概観【JST・京大機械翻訳】

A Comprehensive Overview of Online Resources to Identify and Predict Bacterial Essential Genes

著者 (6件)： Peng Chong (Department of Physics, School of Science, Tianjin University) ,  Lin Yan (Department of Physics, School of Science, Tianjin University) ,  Luo Hao (Department of Physics, School of Science, Tianjin University) ,  Gao Feng (Department of Physics, School of Science, Tianjin University) ,  Gao Feng (Key Laboratory of Systems Bioengineering (Ministry of Education), Tianjin University) ,  Gao Feng (SynBio Research Platform, Collaborative Innovation Center of Chemical Science and Engineering (Tianjin), Tianjin University)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 2331  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ある種の環境における生物の生存または生殖に重要な遺伝子は必須遺伝子として分類される。必須遺伝子は生命の生存機構を解読する上で重要な役割を果たしている。それらは,医薬品と合成生物学に大いに適用される可能性がある。必須遺伝子同定のための実験法の連続的進歩は,in silicoにおける必須遺伝子の研究を容易にする遺伝子必須データの蓄積を加速した。本論文では,トランスポゾン配列決定(Tn-seq)分析,必須遺伝子データベースおよび細菌必須遺伝子を予測するためのオンラインサービスのための生物情報学的ソフトウェアツールを含む,遺伝子必須性に関連するいくつかの利用可能なオンライン資源を提示した。著者らは,必須遺伝子を予測するために用いられたいくつかの計算アプローチをレビューし,遺伝子必須性予測のために使用される特徴を要約する。さらに,DEGからの30細菌の実験的に検証された必須遺伝子セットに基づいて利用可能なオンライン細菌必須遺伝子予測サーバを評価した。本論文は,必須遺伝子に興味を持つ微生物学者のための迅速な参照ガイドであることを意図している。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 支援プログラム ,  微生物学 ,  トランスポゾン ,  *予測 ,  データベース ,  *細菌 ,  *遺伝子 ,  *ハウスキーピング遺伝子
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  オンラインサービス ,  in silico ,  *オンライン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 必須遺伝子 ,  最小遺伝子セット ,  遺伝子必須性予測 ,  合成生物学 ,  TN-seq解析

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 細菌 ,  必須遺伝子 ,  同定 ,  予測 ,  オンライン ,  資源