文献

J-GLOBAL ID：201802237303293436   整理番号：18A1732943

shRNA媒介メラノーマA375細胞Cbl-b遺伝子サイレンシング前後のプロテオミクス解析【JST・京大機械翻訳】

Proteomics analysis in A375 melanoma cells before and after short hairpin RNA-mediated Cbl-b gene silencing

著者 (8件)： Wang Xiaopo (中国医学科学院北京協和医学院皮膚病医院病理科,南京,210042) ,  Ni Nana (中国医学科学院北京協和医学院皮膚病医院病理科,南京,210042) ,  Xiong Jingshu (中国医学科学院北京協和医学院皮膚病医院病理科,南京,210042) ,  Song Hao (中国医学科学院北京協和医学院皮膚病医院病理科,南京,210042) ,  Jiang Yiqun (中国医学科学院北京協和医学院皮膚病医院病理科,南京,210042) ,  Chen Hao (中国医学科学院北京協和医学院皮膚病医院病理科,南京,210042) ,  Ceng Xuesi (中国医学科学院北京協和医学院皮膚病医院病理科,南京,210042) ,  Sun Jianfang (中国医学科学院北京協和医学院皮膚病医院病理科,南京,210042)
資料名： Zhonghua Pifuke Zazhi  (Zhonghua Pifuke Zazhi)
巻： 51  号： 8  ページ： 569-574  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2321A  ISSN： 0412-4030  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】shRNA媒介黒色腫A375細胞のCbl-b遺伝子サイレンシング前後の発現蛋白質を分析する。方法:Cbl-bshRNAレンチウイルスベクター(Cbl-bshRNA群)と対照レンチウイルスベクター(対照群)でトランスフェクションしたA375細胞の差次的発現タンパク質を,非標識定量的プロテオミクス技術を使用して同定した。バイオインフォマティクスを用いて、選別した差異タンパク質に対して遺伝子オントロジーの濃縮及び京都遺伝子とゲノム百科全書(KEGG)通路の濃縮分析を行った。ウェスタンブロット法は,p-AKT発現(EphA2,GSK3β)とCbl-bshRNAサイレンシングの後,p-AKT発現を確認するために使用した。SPSS23.0ソフトウェアを用い、統計分析を行い、両組のタンパク存在度の比較を2サンプルt検定で行った。遺伝子オントロジーとKEGGの濃縮分析の結果は,Fisherの正確確率検定によって検定した。【結果】合計3449の蛋白質を同定し,Cbl-bshRNAと対照群の差次的発現蛋白質74個をスクリーニングした。対照群と比べて,Cbl-bshRNA群の52のタンパク質は上方制御され,22は下方制御された。差次的蛋白質遺伝子のオントロジー濃縮分析により、前5位の顕著な濃縮生物学過程はインテグリン介在細胞粘着、単一生物代謝過程、インテグリン媒介細胞接着調節、タンパク質標的ミトコンドリア調節、核酸代謝過程であることが分かった。前5位の顕著な濃縮分子機能はDNA結合、2鉄硫黄クラスター結合、シグナル受容体活性、カドヘリン結合、細胞接着分子結合である。前5位に著しく濃縮した細胞の成分はヌクレオソーム、DNA包装複合体、光センサー連結繊維、DNA-タンパク質複合体、細胞外領域部分である。京都遺伝子とゲノム百科の全書通路の濃縮分析により、上位5位とメラノーマに関連する顕著な濃縮通路は葉酸生合成、軸索誘導、細胞外基質受容体相互作用、接着結合、Wntシグナル経路を含むことが分かった。ウェスタンブロット法は,Cbl-bshRNA群のEphA2の相対的な発現が,対照群(3.524)で,対照群(3.524)と比較して,対照群(3.524)で増加し,そして,結果は,プロテオミクスの結果と一致していたことを示した。p-AKT発現は,(0.453)減少した。【結語】Cbl-bはメラノーマの病因に関与する可能性があるが,EphA2/PI3K/AKTシグナル伝達経路はメラノーマの形成に関与する重要なメカニズムの1つである可能性がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ウェスタンブロット法 ,  細胞外マトリックス ,  DNA【核酸】 ,  *プロテオミクス ,  アップレギュレーション ,  細胞接着 ,  相互作用 ,  統計解析 ,  病因 ,  生合成 ,  ダウンレギュレーション ,  ミトコンドリア ,  ゲノム ,  *黒色腫 ,  タンパク質複合体

著者キーワード (6件)： Melanoma ,  Ubiquitin-protein ligases ,  Proto-oncogene proteins cbl-b ,  RNA ,  small interfering ,  Proteomics

分類 (3件)： 皮膚の疾患  (GF03000Q) ,  皮膚の腫よう  (GF04000X) ,  皮膚科学一般  (GF01010N)

タイトルに関連する用語 (5件)： shRNA ,  メラノーマ ,  A375細胞 ,  遺伝子サイレンシング ,  プロテオミクス解析