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J-GLOBAL ID：201802237342336852   整理番号：18A0805207

中国ケールのde novoトランスクリプトーム集合と複数組織におけるグルコシノレート代謝に関与する遺伝子の包括的発現解析【JST・京大機械翻訳】

De novo Transcriptome Assembly of Chinese Kale and Global Expression Analysis of Genes Involved in Glucosinolate Metabolism in Multiple Tissues

著者 (6件)： Wu Shuanghua (Department of Vegetable Science, College of Horticulture, South China Agricultural University) ,  Lei Jianjun (Department of Vegetable Science, College of Horticulture, South China Agricultural University) ,  Chen Guoju (Department of Vegetable Science, College of Horticulture, South China Agricultural University) ,  Chen Hancai (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences) ,  Cao Bihao (Department of Vegetable Science, College of Horticulture, South China Agricultural University) ,  Chen Changming (Department of Vegetable Science, College of Horticulture, South China Agricultural University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 92  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アブラナ科の野菜である中国ケールは,その高いグルコシノレート含量と栄養品質により,中国南部と東南アジアにおける人気のある作物である。しかしながら,glucosinラート代謝に関与する分子遺伝学と遺伝子および中国ケールにおけるその調節に関する研究はほとんどない。本研究では,中国ケールの11の組織で発現された遺伝子のトランスクリプトームと発現プロファイルを配列決定し,特性化した。RNA塩基配列決定技術を用いて,全部で2216の150bpのクリーンな読み取りを発生させた。配列から,98,180の単一遺伝子を全植物に対して組み立て,49,58298,423の単一遺伝子を各組織に対して組み立てた。BLAST分析は,全部で80,688(82.18%)の単一遺伝子が既知の蛋白質と類似性を示すことを示した。本研究で用いた機能的アノテーションおよび分類ツールは,主に中国ケールで発現した遺伝子が,細胞および分子機能,シグナル伝達および二次代謝産物の生合成のような基本的過程に関与していることを示唆した。すべての単一遺伝子の発現レベルを,中国ケールの様々な組織で分析した。グルコシノレート代謝とその調節に関与する多数の候補遺伝子を同定し,これらの遺伝子の発現パターンを分析した。グルコシノレート生合成に関与する遺伝子の大部分は根,葉柄,老化葉において高度に発現していることを見出した。RNA-seqからの10のグルコシノレート生合成遺伝子の発現パターンを,異なる組織における定量的RT-PCRによって検証した。これらの結果は,異なる組織における中国ケール遺伝子機能および発現活性の初期および全体的概観を提供した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 二次代謝産物 ,  遺伝子発現 ,  *遺伝子 ,  *グルコシノレート ,  キャラクタリゼーション ,  RNA【核酸】 ,  ヌクレオチド配列 ,  代謝経路 ,  *トランスクリプトーム ,  類似性 ,  生合成 ,  RT-PCR法 ,  *中華人民共和国 ,  タンパク質
準シソーラス用語： *遺伝子発現プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 中国のケール ,  de novo組立 ,  RNA-seq ,  トランスクリプトーム ,  グルコシノレート代謝経路 ,  遺伝子発現 ,  複数の組織

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： 中国 ,  ケール ,  トランスクリプトーム ,  集合 ,  組織 ,  グルコシノレート ,  代謝 ,  遺伝子 ,  発現解析