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J-GLOBAL ID：201802237585685463   整理番号：18A1657849

ヒストンデメチラーゼKDM3Bの急性骨髄性白血病における標的遺伝子同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of the histone demethylase KDM3B target gene in acute myeloid leukemia

著者 (5件)： Song Lei (wei坊医学院,山東wei坊,261042) ,  Xu Xin (wei坊医学院,山東wei坊,261042) ,  Zhao Yao (wei坊医学院附属医院干細胞与再生医学実験室,山東wei坊,261042) ,  Wang Zhanju (wei坊医学院附属医院血液科,山東wei坊,261042) ,  Hu Zhenbo (wei坊医学院附属医院干細胞与再生医学実験室,山東wei坊,261042)
資料名： Xiandai Zhongliu Yixue  (Xiandai Zhongliu Yixue)
巻： 26  号： 8  ページ： 1149-1154  発行年： 2018年 
JST資料番号： C3555A  ISSN： 1672-4992  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:ヒストンH3リジン9位(H3K9)のメチル化は造血と白血病発生における重要なエピジェネティクス修飾であり、ヒストンメチル化酵素と脱メチル化酵素によって正確に調節される。ヒストンH3K9デメチラーゼKDM3Bは潜在的な白血病発生抑制遺伝子である。著者らは白血病におけるKDM3Bの潜在的標的遺伝子を検討する。方法;複数の急性骨髄性白血病細胞株のKDM3B遺伝子を干渉し、マイクロアレイチップ実験を行い、遺伝子セット濃縮分析(GSEA)とVenn分析データを用い、いくつかのKDM3Bの潜在的な標的遺伝子をスクリーニングした。リアルタイムPCRを用いて,CDKN1A遺伝子の結果を検証した。結果;GSEAの分子ラベルデータベース中のマーカー遺伝子セット(H)と確立された遺伝子セット(C2)を比較し、NB-4とPLB-985細胞(それぞれ影響)とKDM3Bと正相関した遺伝子はそれぞれ2375と2007個あり、そのうちP<0.05の遺伝子はそれぞれ89と67であった。KDM3Bと負に関連する遺伝子はそれぞれ1882と2250個あり、そのうちP<0.05の遺伝子はそれぞれ62と67個あり、FLT3、NRAS、EVI1とIL4などの遺伝子を含む。GSEAの分子ラベルデータベース中の染色体位置(C1),構築した遺伝子セット(C2),腫瘍関連遺伝子セット(C4),GO遺伝子セット(C5),腫瘍遺伝子セット(C6),免疫学的遺伝子セット(C7)とマーカー遺伝子セット(H)を比較した。NB-4とPLB-985細胞(共通の影響)は,KDM3Bと正に関連する4815の遺伝子があり,そのうち130はP<0.05であった。KDM3Bと負に関連する遺伝子は4400個あり、そのうちP<0.05の遺伝子は97個あり、POU5F1とCDKN1Aなどの遺伝子を含む。NB-4とPLB-985細胞中のKDM3B遺伝子の発現を妨害し、最も強く影響する600個のプローブをVenn分析で、2種類の細胞株で発現が低下している遺伝子は16個あり、血液病関連遺伝子CCDN3、TRIM24、MAPKI3、・・・SOX6など;RARRES3とCD58は,NB-4細胞で発現したが,PLB-985細胞では,17の遺伝子があった(RARRES3とCD58)。リアルタイム定量的PCRは,KDM3BがPLB-985細胞の中のCDKN1A発現の1.18倍であることを示した。結論:KDM3Bは急性骨髄性白血病関連遺伝子を制御でき、CDKN1Aは潜在的なKDM3B標的遺伝子である。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *メチルトランスフェラーゼ ,  エピジェネティクス ,  染色体 ,  インターロイキン4 ,  癌遺伝子 ,  *急性骨髄性白血病 ,  メチル化 ,  脱メチル ,  プローブ ,  リアルタイムPCR法 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： *標的遺伝子 ,  ヒストンメチル化 ,  ヒストンH3 ,  *ヒストンデメチラーゼ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： AML ,  epigenetics ,  histone demethylases ,  KDM3B ,  microarray ,  GSEA

分類 (3件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  血液の腫よう  (GK04000M) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： ヒストンデメチラーゼ ,  急性骨髄性白血病 ,  標的遺伝子 ,  同定