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J-GLOBAL ID：201802237592777154   整理番号：18A1448767

潜在クラスモデルと主成分法の希少変異係り受け解析への適用比較【JST・京大機械翻訳】

A Comparison of Latent Class Model and Principal Component Analysis in the Application of Rare Variants Association Studies

著者 (7件)： Pi Lucheng (广東薬科大学公共衛生学院統計学教研室 510310) ,  Bo Tao (广東薬科大学公共衛生学院統計学教研室 510310) ,  Ji Xiaohui (广東薬科大学公共衛生学院統計学教研室 510310) ,  Zhao Li (广東薬科大学公共衛生学院統計学教研室 510310) ,  Li Lixia (广東薬科大学公共衛生学院統計学教研室 510310) ,  Liu Li (广東薬科大学公共衛生学院統計学教研室 510310) ,  Gao Yanhui (广東薬科大学公共衛生学院統計学教研室 510310)
資料名： Zhongguo Weisheng Tongji  (Zhongguo Weisheng Tongji)
巻： 35  号： 2  ページ： 194-196,203  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2278A  ISSN： 1002-3674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】希少突然変異の遺伝的関連の研究における潜在的分類モデルと主成分法の統計的性能を比較する。方法:GAW17データベースを用いて、集合戦略を通じて同一遺伝子中の希少変異を新たな変数に合併し、遺伝子を分析単位とする。潜在的分類モデルと主成分法をそれぞれ用いて,一般的な変異と集合の後の稀な変異の分類潜在変数または主成分を構築し,そして,定量的形質に及ぼす遺伝子の全体的効果を,線形回帰モデルを用いて分析した。2つの方法のクラスIエラーと効率を評価した。【結果】潜在的分類モデルのクラスIエラー(0.0400.085)は,主成分法(0.0400.190)より高かった。強い効果の希有変異とよく見られる変異に対して、多数の無相関の希有変異が存在しても、潜在類別モデルは非常に良く分類でき、有効性(1.000)は主成分法(0.9901.)より低かった。000);しかし,希有または常見の変異効果が弱い場合,主成分法の効果(0.635)は潜在分類モデル(0.200)より高かった。多くの非関連遺伝子に対して、潜在クラスモデルは収束しない。結論:主成分法と類似し、潜在類別モデルも希少変異の集合戦略と結合でき、遺伝的変異データの分類潜在変数を構築することにより、希少変異の遺伝相関研究を行う。量的形質の分析において、両法はいずれも強い効果の稀な変異とよく見られる変異を識別でき、集団中の遺伝的変異の分布に異質性がない時、潜在類別モデルは常に収束せず、遺伝的変異と性状には関連がないことが示唆された。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 不均一性 ,  遺伝相関 ,  *変異 ,  遺伝子 ,  *モデル ,  突然変異 ,  データベース
準シソーラス用語： 遺伝的変異 ,  線形回帰モデル ,  量的遺伝形質 ,  潜在変数 ,  分類モデル ,  遺伝的関連研究 ,  係り受け解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Latent class model ,  Principal component analysis ,  Collapsing method ,  Rare variant

分類 (1件)： 公衆衛生  (GB02000X)

タイトルに関連する用語 (3件)： 潜在クラスモデル ,  変異 ,  係り受け解析