抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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【目的】日本脳炎ウイルス(JEV)を迅速に検出し,その遺伝子型を識別するために,TaqManに基づく逆転写酵素定量的ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)検出システムを開発した。【方法】JEV(G1-G5)の完全長配列を調整することによって,高度に特異的TaqManリアルタイムRT-PCRプライマーとプローブの6つのセットをJEVの高度に保存されたNS1,NS2,およびM遺伝子に基づいて設計した。それは特異的JEV遺伝子型の検出のために非特異的JEV検出と5つのセットを含んだ。20バッチの蚊試料を用いて定量的PCRアッセイを評価した。【結果】特異的分析により,他のフラビウイルスは検出されなかった。システムの検出下限は,JEV力価と100RNAコピー/μLに対して1pfu/mLであった。このリアルタイムRT-PCRの変動係数はすべて<2.8%であった。この方法の増幅効率は,90%と103%の間であった。【結論】TaqManリアルタイムRT-PCR検出システムは,すべての5つのJEV遺伝子型を検出し,識別するために首尾よく確立された。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】