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J-GLOBAL ID：201802237787168961   整理番号：18A1407174

ハイスループットシーケンシング技術に基づいた102株の緑膿菌耐性遺伝子研究【JST・京大機械翻訳】

Study on drug resistance genes of 102 strains of Pseudomonas aeruginosa based on high throughput sequencing

著者 (4件)： Fang Xiaolong (广東省深zhen市福田区婦幼保健院検験科,广東深zhen,518045) ,  Wang Liping (广東省深zhen市福田区婦幼保健院検験科,广東深zhen,518045) ,  Zi Jie (广東省深zhen市福田区婦幼保健院検験科,广東深zhen,518045) ,  Zhu Guosheng (广東省深zhen市福田区婦幼保健院検験科,广東深zhen,518045)
資料名： Guoji Jianyan Yixue Zazhi  (Guoji Jianyan Yixue Zazhi)
巻： 39  号： 7  ページ： 773-775  発行年： 2018年 
JST資料番号： C3937A  ISSN： 1673-4130  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】バイオインフォマティクスによる多剤耐性緑膿菌(PAE)の多剤耐性の遺伝子型を調査する。方法:246株の緑膿菌から多剤耐性株をスクリーニングし、アルカリ分解法で目的菌のゲノムとプラスミドDNAを抽出し、ハイスループットシークエンシングを行った。結果:合計102株の多剤耐性株が検出され、21株の広範な薬剤耐性株がポリミキシンBに感受性であった。102株の多剤耐性緑膿菌サンプルは高スループットシークエンシングにより、reads32088766個、長さ98nt、総塩基配列塩基数3.1Gbを産生した。8種類の抗生物質耐性型を発見し、21種類の薬剤耐性遺伝子型を含み、合計16個の遺伝子に69個のヌクレオチドの多型部位が存在し、そのうち8種類の遺伝子型17個の部位に非同義変異が生じた。【結語】ハイスループット混合ゲノム塩基配列決定法は,多剤耐性病原体の多剤耐性遺伝子の分析に適用可能である。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病原体 ,  ゲノム ,  多剤耐性 ,  感受性 ,  *遺伝子 ,  ヌクレオチド ,  ヌクレオチド配列 ,  薬物耐性 ,  遺伝子型 ,  *緑膿菌
準シソーラス用語： 配列解析 ,  *ハイスループット ,  プラスミドDNA ,  バイオインフォマティクス ,  *耐性遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Pseudomonas aeruginosa ,  multidrug resistance ,  high throughput sequencing ,  mixed gene

分類 (4件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  抗細菌薬の基礎研究  (GW17020S) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： 緑膿菌 ,  耐性遺伝子 ,  研究