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J-GLOBAL ID：201802237819669439   整理番号：18A1999989

昼夜サイクルにおける酢酸塩の添加に対する緑藻類Chlamydomonasのトランスクリプトーム応答の驚くべき解析【JST・京大機械翻訳】

Surprisal analysis of the transcriptomic response of the green microalga Chlamydomonas to the addition of acetate during day/night cycles

著者 (4件)： Willamme R. (Genetics and Physiology of Microalgae, UR InBios, Chemin de la Vallee, 4, University of Liege, 4000 Liege, Belgium) ,  Bogaert K.A. (Theoretical Physical Chemistry, UR MOLSYS, Allee du 6 Aout, 11, University of Liege, 4000 Liege, Belgium) ,  Remacle F. (Theoretical Physical Chemistry, UR MOLSYS, Allee du 6 Aout, 11, University of Liege, 4000 Liege, Belgium) ,  Remacle C. (Genetics and Physiology of Microalgae, UR InBios, Chemin de la Vallee, 4, University of Liege, 4000 Liege, Belgium)
資料名： Chemical Physics  (Chemical Physics)
巻： 514  ページ： 154-163  発行年： 2018年 
JST資料番号： D0167B  ISSN： 0301-0104  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究は,微小藻類Chlamydomonasにおける昼間条件下での酢酸同化に依存する遺伝子経路を見出すことを目的とした。酢酸塩代謝に必須のグリオキシル酸サイクルを欠く1つの対照と1つの変異体の2つの株のトランスクリプトームを,酢酸塩による日/夜サイクル下で培養した。著者らは,RNA-seqデータに対する情報理論的アプローチである驚くべき解析を適用した。暗及び光相試料のグループに関する分析を行うことにより,突然変異体と対照試料を識別する制約及び遺伝子経路の同定が可能になった。炭素代謝は対照株の光相で最も重要であるが,暗期は細胞分裂経路に富んでいる。突然変異体表現型は,2つの相におけるストレス応答とオートファジーの遺伝子経路を含む。細胞分裂経路は暗期の光相と異化経路に見られ,これらの周期的培養条件における突然変異体トランスクリプトームの再配線を強調した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *Chlamydomonas ,  代謝 ,  異化 ,  培養条件 ,  オートファジー ,  *トランスクリプトーム ,  表現型 ,  細胞分裂 ,  遺伝子 ,  脂肪酸 ,  薬物
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  暗期 ,  炭素代謝 ,  RNA-seq ,  微小藻類 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 驚くべき解析 ,  トランスクリプトーム ,  日/夜サイクル ,  イソくえん酸リアーゼ ,  Chlamydomonas

分類 (2件)： 分子の電子構造  (BH05010Q) ,  分子化合物  (CE02000C)

物質索引 (1件)： 酢酸

タイトルに関連する用語 (7件)： サイクル ,  酢酸塩 ,  緑藻類 ,  Chlamydomonas ,  トランスクリプトーム ,  応答 ,  解析