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J-GLOBAL ID：201802237864864713   整理番号：18A1136662

高高度疾患における遺伝子の機能的関連を発見するためのテキストマイニングとネットワーク分析【JST・京大機械翻訳】

Text mining and network analysis to find functional associations of genes in high altitude diseases

著者 (4件)： Bhasuran Balu (DRDO-BU Center for Life Sciences, Bharathiar University Campus, Coimbatore, 641046, India) ,  Subramanian Devika (Data Mining and Text Mining Laboratory, Department of Bioinformatics, Bharathiar University, Coimbatore, 641046, India) ,  Natarajan Jeyakumar (DRDO-BU Center for Life Sciences, Bharathiar University Campus, Coimbatore, 641046, India) ,  Natarajan Jeyakumar (Data Mining and Text Mining Laboratory, Department of Bioinformatics, Bharathiar University, Coimbatore, 641046, India)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 75  ページ： 101-110  発行年： 2018年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 2500mを超える高度への旅行は,急性山岳病(AMS),高高度脳浮腫(HACE)または高高度肺水腫(HAPE)のような急性高度疾患の1つまたはそれ以上の形態を発達させるリスクと関連している。本研究は,高地疾患に関与する遺伝子の機能的関連を同定することを目的とした。本研究では,文献とネットワーク分析からの遺伝子共起統計の原理を用いることにより,高高度疾患の原因となる遺伝子ネットワークを同定した。最初に,著者らは,高高度疾患に関するPubMedからの文献データをマイニングして,共存する遺伝子対を抽出した。次に,それらの共起頻度に基づいて,遺伝子対をランク付けした。最後に,遺伝子会合ネットワークを統計的尺度を用いて作成し,潜在的関係を調べた。ネットワーク分析結果は,EPO,ACE,IL6およびTNFが20以上の遺伝子と共存することが見出されたトップ5遺伝子であり,一方,EPAS1とEGLN1遺伝子の間の会合は強く実証された。本研究から構築されたネットワークは,高高度条件で働く多数の遺伝子を提案する。全体として,結果は,高地疾患における遺伝的関係のさらなる研究のための良い参照を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 等級づけ ,  肺水腫 ,  高山病 ,  脳浮腫 ,  高地 ,  インターロイキン6 ,  *遺伝子 ,  *ネットワーク ,  *遺伝
準シソーラス用語： PubMed ,  遺伝子ネットワーク ,  *ネットワーク解析 ,  *テキストマイニング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： テキストマイニング ,  遺伝子共起 ,  ネットワーク解析 ,  高地疾患

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 高高度 ,  疾患 ,  遺伝子 ,  発見 ,  テキストマイニング ,  ネットワーク分析