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J-GLOBAL ID：201802238078524274   整理番号：18A2060910

天然産生および改変ペプチド骨格を立体配座的に制限するためのアミノ酸修飾:蛋白質データバンクからの洞察【JST・京大機械翻訳】

Amino acid modifications for conformationally constraining naturally occurring and engineered peptide backbones: Insights from the Protein Data Bank

著者 (7件)： Di Costanzo Luigi (RCSB Protein Data Bank, Center for Integrative Proteomics Research, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ, U.S.A.) ,  Dutta Shuchismita (RCSB Protein Data Bank, Center for Integrative Proteomics Research, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ, U.S.A.) ,  Dutta Shuchismita (Institute for Quantitative Biomedicine, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ, U.S.A.) ,  Burley Stephen K. (RCSB Protein Data Bank, Center for Integrative Proteomics Research, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ, U.S.A.) ,  Burley Stephen K. (Institute for Quantitative Biomedicine, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ, U.S.A.) ,  Burley Stephen K. (RCSB Protein Data Bank, San Diego Supercomputer Center, University of California San Diego, La Jolla, CA, U.S.A.) ,  Burley Stephen K. (Rutgers Cancer Institute of New Jersey, Rutgers, The State University of New Jersey, New Brunswick, NJ, U.S.A.)
資料名： Biopolymers  (Biopolymers)
巻： 109  号： 10  ページ： e23230  発行年： 2018年 
JST資料番号： C0766A  ISSN： 0006-3525  CODEN： BIPMAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質/ペプチドのde novo設計において,蛋白質折畳みの規則を理解するのに投資されている広範な努力が現在適用されている。標準的なα-アミノ酸のみを含む蛋白質に対して,蛋白質と生物学的に活性なペプチドの実験的に決定された三次元(3D)構造から得られた知識は,蛋白質データバンク(PDB)とCambridge構造データベース(CSD)から入手可能である。これらは合理的な信頼性で蛋白質構造を予測し設計する助けとなる。しかし,骨格修飾アミノ酸を含む生体分子の3D構造に関する知識はまだ進化している。de novo蛋白質/ペプチド設計における主要な課題は,特異的な構造要素を有する立体配座的に制約された分子の工学と生物学的活性のために適切に位置づけられた化学基に関するものである。本レビューでは,蛋白質/ペプチド骨格構造を制約する4種類のアミノ酸修飾を調べた。PDBとCSDに見られるこれらの骨格修飾アミノ酸を含むペプチド分子構造(eg,生物活性ペプチド,阻害剤,抗生物質,及び設計分子)の系統的解析を論じた。本レビューは,蛋白質/ペプチドの将来の設計を誘導する構造-機能洞察を提供することを目的とした。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生理活性ペプチド ,  *ペプチド ,  データベース ,  *タンパク質 ,  *立体配座 ,  *アミノ酸 ,  三次元 ,  生物活性 ,  抗生物質
準シソーラス用語： 阻害剤 ,  生体分子 ,  蛋白質構造 ,  α-アミノ酸 ,  蛋白質折畳み ,  de novo設計 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 骨格修飾アミノ酸 ,  ペプチドの立体配座 ,  構造データアーカイブ ,  分子ツール

分類 (3件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  生理活性ペプチド  (EB08100U) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (9件)： 改変 ,  ペプチド ,  骨格 ,  立体配座 ,  制限 ,  アミノ酸 ,  修飾 ,  蛋白質データバンク ,  洞察