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J-GLOBAL ID：201802238234221161   整理番号：18A0796094

悪性中皮腫患者における胸膜液からの悪性細胞は新規変異を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Malignant cells from pleural fluids in malignant mesothelioma patients reveal novel mutations

著者 (16件)： Sneddon Sophie (National Centre for Asbestos Related Disease, University of Western Australia, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Dick Ian (National Centre for Asbestos Related Disease, University of Western Australia, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Lee Y.C. Gary (Pleural Medicine Unit, Institute for Respiratory Health, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Lee Y.C. Gary (Department of Respiratory Medicine, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Musk A.W. (Bill) (National Centre for Asbestos Related Disease, University of Western Australia, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Musk A.W. (Bill) (Department of Respiratory Medicine, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Musk A.W. (Bill) (School of Population Health, University of Western Australia, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Patch Ann-Marie (QIMR Berghofer Medical Research Institute, Brisbane, Queensland, 4006, Australia) ,  Pearson John V. (QIMR Berghofer Medical Research Institute, Brisbane, Queensland, 4006, Australia) ,  Waddell Nicola (QIMR Berghofer Medical Research Institute, Brisbane, Queensland, 4006, Australia) ,  Allcock Richard J.N. (School of Pathology and Laboratory Medicine, University of Western Australia, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Allcock Richard J.N. (Pathwest Laboratory Medicine, QEII Medical Centre, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Holt Robert A. (Michael Smith Genome Sciences Centre, BC Cancer Agency, British Columbia, Canada) ,  Robinson Bruce W.S. (National Centre for Asbestos Related Disease, University of Western Australia, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Robinson Bruce W.S. (Department of Respiratory Medicine, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia) ,  Creaney Jenette (National Centre for Asbestos Related Disease, University of Western Australia, Nedlands, Western Australia, 6009, Australia)
資料名： Lung Cancer  (Lung Cancer)
巻： 119  ページ： 64-70  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3184A  ISSN： 0169-5002  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 悪性中皮腫(MM)はしょう膜空洞の細胞に影響するアスベスト関連腫瘍である。MM患者の70%以上は,腫瘍細胞を含む胸水を発生させ,遺伝子解析のための悪性細胞の容易にアクセス可能なソースを表している。一般的な体細胞突然変異と損失は固形MM腫瘍で同定されているが,胸水中の腫瘍細胞の特性化は新しい洞察を提供できるが,ほとんど研究されていない。27人のヒトMM胸水試料の短期間培養からDNAとRNAを細胞から抽出した。全体のexomeとトランスクリプトーム配列決定は,Ion Torrentプラットフォームを使用して実行した。体細胞突然変異をVarScan2とSomaticSniperを用いて同定した。コピー数変化は,RにおけるExomeCNVを用いて同定された。GISTIC2.0を用いて全試料を通して有意なコピー数変化を同定した。腫瘍固有の特性と生存の間の関係を,Cox比例ハザード回帰モデルを用いて分析した。著者らは,MM胸膜浸出液からの細胞におけるBAP1,CDKN2AおよびNF2の変化を,外科シリーズからのMM腫瘍で典型的に見られるよりも高い頻度で同定した。突然変異率の中央値は1.09突然変異/Mbであった。TRAF7とLATS2の変化も高頻度で同定された(それぞれ66%と59%)。FGFR3の変化を含む興味のある新しい領域を同定し,領域19p13.3,8p23.1及び1p36.32を同定した。MM胸水からの腫瘍細胞の短期培養は,MMゲノミクスの研究における外科的腫瘍生検へのアクセス可能な代替法を提供し,興味のある新しい突然変異を明らかにする。胸水腫瘍細胞は,MM腫瘍の腫瘍動態,治療反応およびクローン進化のモニタリングの機会を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 突然変異 ,  *患者 ,  腫瘍 ,  トランスクリプトーム ,  *中皮腫 ,  コピー数 ,  ヒト ,  回帰モデル ,  DNA【核酸】 ,  キャラクタリゼーション ,  培養 ,  腫瘍細胞 ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： 体細胞突然変異 ,  遺伝子解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 中皮腫 ,  シークエンシング ,  胸水 ,  突然変異景観 ,  新しい変異

分類 (3件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  呼吸器の腫よう  (GI04000G) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 悪性中皮腫 ,  患者 ,  胸膜液 ,  性細胞 ,  変異