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J-GLOBAL ID：201802238288202929   整理番号：18A2061628

連続的に劣化したサンプルに関するIlluminaのForenseqシステムの性能評価【JST・京大機械翻訳】

Evaluation of the performance of Illumina’s ForenSeq system on serially degraded samples

著者 (9件)： Zhang Qingzhen (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China) ,  Zhou Zhe (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China) ,  Liu Qiqi (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China) ,  Liu Liyan (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China) ,  Shao Liting (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China) ,  Zhang Minli (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China) ,  Ding Xiaoran (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China) ,  Gao Yue (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China) ,  Wang Shengqi (The Genomics Center of the AMMS, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing, P. R. China)
資料名： Electrophoresis  (Electrophoresis)
巻： 39  号： 21  ページ： 2674-2684  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0626B  ISSN： 0173-0835  CODEN： ELCTDN  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 次世代配列決定の利用は,法医学的ゲノミクスの分野で増加している。本研究では,分解および低鋳型DNAからの法医学的ゲノム配列決定情報の回収におけるIllinaのMiSeqFGXシステムの性能を評価した。分析は,1ngから5pgの範囲の2800m DNAを用いた感度研究を含んだ。DNAは,98°C,10,20,30,40,50,60,70,120及び180分(0.837から232.247の範囲の分解指数値をもたらす)において,2800M DNAを培養することにより人工的及び系統的に分解された。結果は,検出された対立遺伝子コール頻度が,DNA入力が>50pgまたは分解指数が72.28より低いとき,80%以上であることを明らかにした。試料を120分以上加熱したとき,または入力量が25pg未満のとき,対立遺伝子バランスは0.6より低かった。また,著者らのデータは,スタッタ型と比率が特異的遺伝子座に依存することを示した。一方,配列決定はノイズ発生における最も重要な因子であった。本研究の結果は,ForenSeq FGXシステムを用いた挑戦的な試料の分析のための研究室を開発するのに役立つであろう。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 法医学 ,  雑音発生 ,  *DNA【核酸】 ,  対立遺伝子 ,  性能評価
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： DNA分解 ,  法医学 ,  低テンプレートDNA ,  次世代シークエンシング

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  電気泳動分析  (CC04017K)

タイトルに関連する用語 (2件)： サンプル ,  性能評価