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J-GLOBAL ID：201802238649081180   整理番号：18A0966169

ゲノムから遺伝子型へ:Chlamydia gallinaceaの分子疫学的解析はこの新たに出現するクラミジア病原体に対する高レベルの遺伝的多様性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

From genomes to genotypes: molecular epidemiological analysis of Chlamydia gallinacea reveals a high level of genetic diversity for this newly emerging chlamydial pathogen

著者 (12件)： Guo Weina (Jiangsu Co-Innovation Center for Prevention and Control of Important Animal Infectious Diseases and Zoonoses, Yangzhou University College of Veterinary Medicine, Yangzhou, People’s Republic of China) ,  Guo Weina (College of Animal Science, Anhui Science and Technology University, Maanshan, China) ,  Jelocnik Martina (Centre for Animal Health Innovation, Faculty of Science, Health, Education and Engineering, University of the Sunshine Coast, Maroochydore, Australia) ,  Li Jing (Jiangsu Co-Innovation Center for Prevention and Control of Important Animal Infectious Diseases and Zoonoses, Yangzhou University College of Veterinary Medicine, Yangzhou, People’s Republic of China) ,  Sachse Konrad (Institute of Bioinformatics, Friedrich-Schiller-Universitaet Jena, Jena, Germany) ,  Polkinghorne Adam (Centre for Animal Health Innovation, Faculty of Science, Health, Education and Engineering, University of the Sunshine Coast, Maroochydore, Australia) ,  Pannekoek Yvonne (Department of Microbiology, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  Kaltenboeck Bernhard (College of Veterinary Medicine, Auburn University, Auburn, USA) ,  Gong Jiansen (Poultry Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Jiangsu Co-Innovation Center for Prevention and Control of Important Animal Infectious Diseases and Zoonoses, Yangzhou, China) ,  You Jinfeng (Jiangsu Co-Innovation Center for Prevention and Control of Important Animal Infectious Diseases and Zoonoses, Yangzhou University College of Veterinary Medicine, Yangzhou, People’s Republic of China) ,  Wang Chengming (Jiangsu Co-Innovation Center for Prevention and Control of Important Animal Infectious Diseases and Zoonoses, Yangzhou University College of Veterinary Medicine, Yangzhou, People’s Republic of China) ,  Wang Chengming (College of Veterinary Medicine, Auburn University, Auburn, USA)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 949  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Chlamyia(C.) gallinaceaは,主に国内のニワトリを感染させる最近同定された細菌である。ヒト非定型肺炎におけるC.gallinaceaの実証は,その人畜共通の可能性を示唆する。ニワトリにおけるその罹患率はC.psittaciのそれを超えているが,C.gallinaceaに関する遺伝的およびゲノム研究はまだ始まっている。本研究では,無症候性ニワトリから分離したC.gallinacea株JX-1の全ゲノム配列決定とC.gallinacea株と関連クラミジア種間の比較ゲノム解析を行った。C.gallinacea JX-1のゲノムを単一分子,リアルタイム技術により配列決定し,全体G+C含有量37.93%,配列類似性99.4%からタイプ株08-1274/3を有する1059,52-bp円形染色体から成る。加えて,2点突然変異を除いて,タイプ株のp1274とほとんど同一のpJX-1と指定されたプラスミドは,ニワトリからの野外株でのみ見出されたが,他の宿主では見出されなかった。顕著に変動する多形性膜蛋白質(pmp)遺伝子と可塑性領域(PZ)を持つクラミジア種と対照的に,これらの領域は両方のC.gallinacea株で保存されていた。15の予測されたpmp遺伝子があったが,B,A,E1,H,G1およびG2だけが,両方の株で明らかに無傷であった。PZが50kbpに至る可能性があるクラミジア種と比較して,C.gallinacea株は,細胞毒(tox)遺伝子における早発STOPコドンを有する株JX-1を有するPZ(14kbp)における遺伝子含有量減少を示したが,tox遺伝子はタイプ株において無傷であった。多遺伝子座配列タイピング(MLST)において,15のC.gallinacea STsは,連結配列の同族MLST対立遺伝子プロファイルに基づいて25株の間で同定された。タイプ株とすべての中国株は2つの異なる系統発生クレードに属する。中国株のクレードは14の遺伝的に異なる系統に分離し,中国におけるC.gallinacea株のかなりの遺伝的多様性を明らかにした。C.gallinaceaのこの最初の詳細な比較ゲノム解析において,C.gallinacea株間の実質的な遺伝的多様性の証拠を提供した。これらの遺伝的多型性がC.gallinaceaの生物学と病原性にどのように影響するかは,この色素性細菌の系統発生学と宿主適応に焦点を当てた将来の研究において取り組むべきである。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *病原体 ,  *遺伝 ,  中華人民共和国 ,  膜タンパク質 ,  系統発生 ,  *Chlamydia ,  点突然変異 ,  遺伝子多型 ,  *遺伝子型 ,  *遺伝子 ,  *ゲノム ,  ヒト ,  病原性 ,  プラスミド
準シソーラス用語： ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Chlamydia gallinacea ,  全ゲノム配列 ,  比較ゲノミクス分析 ,  MLST ,  系統発生解析

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (50件)：

• Vet J; Avian chlamydiosis: two more bacterial players discovered; K Sachse, K Laroucau; 200; 3; 2014; 347-348; 10.1016/j.tvjl.2014.03.017; citation_id=CR1
• Vet Microbiol; Chlamydia pecorum is the endemic intestinal species in cattle while C. gallinacea, C. psittaci and C. pneumoniae associate with sporadic systemic infection; J Li, W Guo, B Kaltenboeck, K Sachse, Y Yang, G Lu; 193; 2016; 93-99; 10.1016/j.vetmic.2016.08.008; citation_id=CR2
• Li L, Luther M, Macklin K, Pugh D, Li J, Zhang J, et al. Chlamydia gallinacea: a widespread emerging Chlamydia agent with zoonotic potential in backyard poultry. Epidemiol Infect. 2017;145(13):2701-3.
• Sci Rep; Chlamydia gallinacea, not C. psittaci, is the endemic chlamydial species in chicken (Gallus gallus); W Guo, J Li, B Kaltenboeck, J Gong, W Fan, C Wang; 6; 2016; 19638; 10.1038/srep19638; citation_id=CR4
• Environ Microbiol; Molecular characterization of atypical Chlamydia and evidence of their dissemination in different European and Asian chicken flocks by specific real-time PCR; A Zocevic, F Vorimore, C Marhold, D Horvatek, D Wang, B Slavec; 14; 8; 2012; 2212-2222; 10.1111/j.1462-2920.2012.02800.x; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： ゲノム ,  遺伝子型 ,  Chlamydia ,  分子疫学 ,  解析 ,  クラミジア ,  病原体 ,  高レベル ,  遺伝的多様性