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J-GLOBAL ID：201802238715084668   整理番号：18A0339982

ウラシルとチミンの共鳴Ramanスペクトルに及ぼすH_2Oとの水素結合の影響【Powered by NICT】

Effects of hydrogen bonding with H₂O on the resonance Raman spectra of uracil and thymine

著者 (2件)： Sun Shuai (Department of Chemistry, University of Alberta, Edmonton, AB T6G 2G2, Canada) ,  Brown Alex (Department of Chemistry, University of Alberta, Edmonton, AB T6G 2G2, Canada)
資料名： Computational & Theoretical Chemistry  (Computational & Theoretical Chemistry)
巻： 1100  ページ： 70-82  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2300A  ISSN： 2210-271X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウラシルとチミンの共鳴Ramanスペクトルに及ぼすH_2Oによる陽的水素結合の効果を,計算により検討した。最低エネルギーウラシルH_2OとチミンH_2O錯体を形成するウラシルとチミンの三結合サイト,二水を含む低準位のより限られた数だけでなく,を考察した。基底状態構造はH_2O(C PCM)における理論のPBE0/aug cc pVTZレベルで最適化し,明るい励起状態(S 1)の勾配はH_2O(C PCM)における理論のTD CAM B3LYP/aug-cc-pVTZレベルで計算した。共鳴Ramanスペクトルは基底状態基準モードと励起状態直交勾配(Herzberg-Teller定式化の枠内で)に支配されているので,n=1または2,ウラシルおよびチミン-(H_2O)のスペクトル間の差は,これら二因子の観点から比較した。孤立分子と比較した場合,水の陽的水素結合がウラシルおよびチミンの共鳴Ramanスペクトルの相対的ピーク位置と強度の両方の変化を引き起こすことが分かった。水素結合の影響は基底状態基準モード特性,特に高周波数モード(>1600cm~ 1)のための,よりも励起状態直交勾配に主に行われる。異なる水素結合部位は得られた共鳴Ramanスペクトルへの種々の寄与を持つことが見出され,環窒素と反対カルボニル結合への明確な水素結合の介在物であるウラシルとチミンのシミュレーションと実験的共鳴Ramanスペクトル間の良好な一致を得るために必要である。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： HF【周波数】 ,  励起状態 ,  基底状態 ,  錯体 ,  定式化 ,  *水素結合 ,  直交性 ,  基準モード ,  結合部位 ,  *共鳴Ramanスペクトル ,  *スペクトル ,  窒素 ,  最適化 ,  窒素複素環化合物 ,  ウレア化合物 ,  ヒドロキシ化合物

著者キーワード (5件)： ウラシル ,  チミン ,  励起電子状態 ,  励起状態の勾配 ,  時間依存密度汎関数理論

分類 (2件)： ピリミジン  (CF07103W) ,  有機化合物の赤外スペクトル及びRaman散乱,Ramanスペクトル  (BM08064T)

物質索引 (2件)： チミン ,  ウラシル

タイトルに関連する用語 (4件)： ウラシル ,  チミン ,  共鳴Ramanスペクトル ,  水素結合