文献

J-GLOBAL ID：201802238761358133   整理番号：18A1574690

絶滅危惧植物ヒツジの全ゲノムSSRマーカー開発と同定研究【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide Identification of SSR Markers in Endangered Species Rhododendron molle G.Don

著者 (7件)： Liu Menglu (江西師范大学生命科学学院,南昌,330022) ,  Dai Liangfang (江西師范大学生命科学学院,南昌,330022) ,  Cheng Malong (江西師范大学生命科学学院,南昌,330022) ,  Zhang Jin (江西師范大学生命科学学院,南昌,330022) ,  Li Haiyan (江西師范大学生命科学学院,南昌,330022) ,  Xie Jiankun (江西師范大学生命科学学院,南昌,330022) ,  Luo Xiangdong (江西師范大学生命科学学院,南昌,330022)
資料名： Xibei Zhiwu Xuebao  (Xibei Zhiwu Xuebao)
巻： 38  号： 5  ページ： 850-857  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2196A  ISSN： 1000-4025  CODEN： XZXUEV  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では,全ゲノム制限酵素断片化(RAD-seq)技術に基づき,絶滅危惧植物ヒツジ(RhodendronmolleG.Don)の全ゲノムSSRマーカーを開発した。3つの集団からの63のヒツジ材料の検証と同定は,ヒツジの遺伝的多様性と個体群の遺伝的構造と保護利用のさらなる研究のための技術的支援を提供する。結果は以下のことを示した:(1)ヒツジのゲノムDNAは,7.653Gbpの元のデータを得て,7.513Gbpの濾過後に,498252contigsの配列で,ヒツジの171.534Mbpの遺伝子の分布を示した。(2)SSRにより11961SSR遺伝子座で11687対のSSR分子マーカーが得られ,そして,ジヌクレオチドは51.76%の反復型であった。(3)128対のSSRマーカーを,6つのヒツジ系統でPCR増幅して,20対のSSRマーカーを得た。(4)選択した20対の多型SSRマーカーを用いて、3つの集団の63のヒツジの材料に対して検証分析を行った結果、これらの多型SSRマーカー遺伝子座の対立遺伝子の数は416で、期待ヘテロ接合度(He)は0.4890.908であった。研究により、羊zhi躅のSSR豊富度が適切で、しかもジヌクレオチドがヒツジの最も豊富な反復配列であり、この実験はRAD-seq技術が経済的で有効な遺伝子シーケンシング方法であることを証明した。開発したSSRプライマーは,ヒツジと他の近縁種の集団構造と多様性をさらに研究するために有用であった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 反復配列 ,  ジヌクレオチド ,  対立遺伝子 ,  個体群 ,  遺伝子 ,  PCR法 ,  DNA制限酵素 ,  ヘテロ接合 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： 集団構造 ,  近縁種 ,  分子マーカー ,  ゲノムDNA ,  *マイクロサテライトマーカー ,  *絶滅危惧植物 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： endangered species ,  Rhododendron molle G.Don ,  microsatellites ,  polymorphic

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： 絶滅危惧植物 ,  ヒツジ ,  ゲノム ,  SSRマーカー ,  開発 ,  同定 ,  研究