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J-GLOBAL ID：201802239325858640   整理番号：18A1918682

動的クロマチン構造:4Dヌクレオームのデータやモデルの基準作成に向けた課題とガイドライン

Challenges and guidelines toward 4D nucleome data and model standards

著者 (23件)： MARTI-RENOM Marc A. (Barcelona Inst. of Sci. and Technol. (BIST), Barcelona, ESP) ,  MARTI-RENOM Marc A. (Universitat Pompeu Fabra (UPF), Barcelona, ESP) ,  MARTI-RENOM Marc A. (ICREA, Barcelona, ESP) ,  ALMOUZNI Genevieve (PSL Res. Univ., Paris, FRA) ,  BICKMORE Wendy A. (Univ. Edinburgh, Edinburgh, GBR) ,  BYSTRICKY Kerstin (Centre de Biologie Integrative (CBI), Univ. Toulouse, UPS, Toulouse, FRA) ,  CAVALLI Giacomo (Univ. Montpellier, Montpellier, FRA) ,  FRASER Peter (Babraham Inst., Cambridge, GBR) ,  FRASER Peter (Florida State Univ., Florida, USA) ,  GASSER Susan M. (Friedrich Miescher Inst. for Biomedical Res., Basel, CHE) ,  GIORGETTI Luca (Friedrich Miescher Inst. for Biomedical Res., Basel, CHE) ,  GASSER Susan M. (Univ. Basel, Basel, CHE) ,  HEARD Edith (PSL Res. Univ., Paris, FRA) ,  NICODEMI Mario (Universita di Napoli “Federico II“, Naples, ITA) ,  NICODEMI Mario (Berlin Inst., Health, Berlin, DEU) ,  POMBO Ana (Berlin Inst., Health, Berlin, DEU) ,  NOLLMANN Marcelo (Univ. de Montpellier, Montpellier, FRA) ,  OROZCO Modesto (Barcelona Inst. of Sci. and Technol. (BIST), Barcelona, ESP) ,  OROZCO Modesto (Universitat de Barcelona, Barcelona, ESP) ,  POMBO Ana (Max Delbrueck Center for Molecular Medicine, Berlin, DEU) ,  POMBO Ana (Humboldt-Universitat zu Berlin, Berlin, DEU) ,  TORRES-PADILLA Maria-Elena (Helmholtz Zentrum Munchen, Muenchen, DEU) ,  TORRES-PADILLA Maria-Elena (Ludwig-Maximilians Universitat, Muenchen, DEU)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 50  号： 10  ページ： 1352-1358  発行年： 2018年10月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 実験的手法や理論的手法の最近の進歩により,生命科学分野において核の動的な三次元構造(3D)の研究が非常に活発化している。現在の我々の理解では,細胞が基本的な機能を遂行する際に,直鎖状のゲノムが折りたたまれることで,遺伝子発現機構を調節し得る。重要なことは,現在,ゲノムが核内で折りたたまれて,時間の経過(4D)とともに変化する仕組みについての3Dモデルの構築が可能になっていることである。ゲノムの折りたたみは,その機能に影響を及ぼすので,これは,細胞運命の決定機構についての我々の理解を広げるための興味深い新たな探索の可能性を開くものである。しかし,方法の迅速な進展やデータの複雑性の増加は,曖昧さや再現性の問題を引き起こすことがあり,この分野の進歩を妨げている可能性がある。本論文では,そのような課題について先んじて述べ,実験的な4Dヌクレオームのデータセットやモデルに共有される標準化された検証戦略について考えるためのガイドラインを示す。Copyright Nature Japan KK 2018

シソーラス用語： *ゲノム ,  遺伝子発現 ,  曖昧さ ,  標準化 ,  折畳み ,  ライフサイエンス ,  再現性 ,  三次元 ,  三次元モデル
準シソーラス用語： 複雑性 ,  細胞運命 ,  三次元構造 ,  *クロマチン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (3件)： クロマチン構造 ,  モデル ,  ガイドライン